Protein–RNA interactions for Protein: O96006

ZBED1, Zinc finger BED domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 694 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED1O96006 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZBED1O96006 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZBED1O96006 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZBED1O96006 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ZBED1O96006 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZBED1O96006 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZBED1O96006 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZBED1O96006 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZBED1O96006 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZBED1O96006 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZBED1O96006 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZBED1O96006 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZBED1O96006 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZBED1O96006 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZBED1O96006 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZBED1O96006 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZBED1O96006 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZBED1O96006 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZBED1O96006 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZBED1O96006 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZBED1O96006 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZBED1O96006 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZBED1O96006 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZBED1O96006 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZBED1O96006 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ZBED1O96006 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZBED1O96006 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZBED1O96006 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
ZBED1O96006 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZBED1O96006 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ZBED1O96006 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ZBED1O96006 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZBED1O96006 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ZBED1O96006 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZBED1O96006 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ZBED1O96006 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ZBED1O96006 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ZBED1O96006 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZBED1O96006 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZBED1O96006 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ZBED1O96006 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ZBED1O96006 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZBED1O96006 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ZBED1O96006 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
ZBED1O96006 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ZBED1O96006 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ZBED1O96006 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ZBED1O96006 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ZBED1O96006 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ZBED1O96006 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
ZBED1O96006 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ZBED1O96006 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ZBED1O96006 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ZBED1O96006 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
ZBED1O96006 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ZBED1O96006 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ZBED1O96006 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ZBED1O96006 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ZBED1O96006 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZBED1O96006 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ZBED1O96006 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZBED1O96006 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZBED1O96006 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ZBED1O96006 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZBED1O96006 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ZBED1O96006 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZBED1O96006 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZBED1O96006 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ZBED1O96006 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ZBED1O96006 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZBED1O96006 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZBED1O96006 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ZBED1O96006 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZBED1O96006 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZBED1O96006 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZBED1O96006 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZBED1O96006 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZBED1O96006 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZBED1O96006 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ZBED1O96006 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZBED1O96006 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZBED1O96006 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZBED1O96006 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZBED1O96006 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZBED1O96006 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZBED1O96006 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ZBED1O96006 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZBED1O96006 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZBED1O96006 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZBED1O96006 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZBED1O96006 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZBED1O96006 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ZBED1O96006 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZBED1O96006 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZBED1O96006 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ZBED1O96006 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZBED1O96006 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZBED1O96006 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZBED1O96006 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZBED1O96006 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.6 ms