Protein–RNA interactions for Protein: O95484

CLDN9, Claudin-9, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN9O95484 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLDN9O95484 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLDN9O95484 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLDN9O95484 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDN9O95484 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDN9O95484 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDN9O95484 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDN9O95484 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDN9O95484 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDN9O95484 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDN9O95484 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDN9O95484 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDN9O95484 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDN9O95484 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDN9O95484 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDN9O95484 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDN9O95484 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDN9O95484 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDN9O95484 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDN9O95484 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDN9O95484 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDN9O95484 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDN9O95484 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDN9O95484 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDN9O95484 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDN9O95484 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDN9O95484 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDN9O95484 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDN9O95484 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDN9O95484 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDN9O95484 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDN9O95484 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDN9O95484 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDN9O95484 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDN9O95484 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDN9O95484 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDN9O95484 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDN9O95484 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDN9O95484 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDN9O95484 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDN9O95484 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDN9O95484 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDN9O95484 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDN9O95484 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDN9O95484 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDN9O95484 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDN9O95484 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDN9O95484 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDN9O95484 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDN9O95484 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDN9O95484 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDN9O95484 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN9O95484 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN9O95484 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN9O95484 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN9O95484 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN9O95484 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN9O95484 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN9O95484 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN9O95484 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN9O95484 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN9O95484 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN9O95484 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN9O95484 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN9O95484 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN9O95484 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN9O95484 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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CLDN9O95484 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN9O95484 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN9O95484 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN9O95484 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN9O95484 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN9O95484 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN9O95484 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN9O95484 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN9O95484 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN9O95484 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN9O95484 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN9O95484 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN9O95484 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN9O95484 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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CLDN9O95484 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN9O95484 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN9O95484 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN9O95484 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN9O95484 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN9O95484 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN9O95484 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN9O95484 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN9O95484 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN9O95484 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN9O95484 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN9O95484 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN9O95484 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN9O95484 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN9O95484 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN9O95484 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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