Protein–RNA interactions for Protein: O75600

GCAT, 2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCATO75600 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GCATO75600 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GCATO75600 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GCATO75600 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GCATO75600 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GCATO75600 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GCATO75600 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GCATO75600 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GCATO75600 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GCATO75600 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GCATO75600 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GCATO75600 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GCATO75600 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GCATO75600 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GCATO75600 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GCATO75600 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GCATO75600 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GCATO75600 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GCATO75600 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GCATO75600 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GCATO75600 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GCATO75600 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GCATO75600 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GCATO75600 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GCATO75600 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GCATO75600 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GCATO75600 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GCATO75600 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GCATO75600 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GCATO75600 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GCATO75600 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GCATO75600 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GCATO75600 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GCATO75600 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GCATO75600 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GCATO75600 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GCATO75600 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GCATO75600 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GCATO75600 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GCATO75600 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GCATO75600 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GCATO75600 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GCATO75600 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GCATO75600 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GCATO75600 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GCATO75600 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
GCATO75600 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GCATO75600 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GCATO75600 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GCATO75600 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GCATO75600 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
GCATO75600 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GCATO75600 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GCATO75600 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GCATO75600 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GCATO75600 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
GCATO75600 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GCATO75600 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GCATO75600 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GCATO75600 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GCATO75600 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GCATO75600 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
GCATO75600 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
GCATO75600 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
GCATO75600 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
GCATO75600 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GCATO75600 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GCATO75600 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GCATO75600 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GCATO75600 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GCATO75600 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GCATO75600 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GCATO75600 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GCATO75600 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GCATO75600 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GCATO75600 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GCATO75600 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GCATO75600 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GCATO75600 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GCATO75600 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GCATO75600 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GCATO75600 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GCATO75600 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GCATO75600 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GCATO75600 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GCATO75600 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GCATO75600 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GCATO75600 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GCATO75600 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GCATO75600 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GCATO75600 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GCATO75600 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GCATO75600 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GCATO75600 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GCATO75600 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GCATO75600 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GCATO75600 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GCATO75600 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GCATO75600 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GCATO75600 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms