Protein–RNA interactions for Protein: O75396

SEC22B, Vesicle-trafficking protein SEC22b, humanhuman

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Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC22BO75396 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEC22BO75396 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEC22BO75396 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEC22BO75396 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEC22BO75396 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEC22BO75396 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEC22BO75396 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEC22BO75396 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEC22BO75396 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEC22BO75396 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEC22BO75396 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEC22BO75396 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEC22BO75396 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEC22BO75396 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEC22BO75396 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEC22BO75396 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SEC22BO75396 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEC22BO75396 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEC22BO75396 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEC22BO75396 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SEC22BO75396 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEC22BO75396 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SEC22BO75396 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEC22BO75396 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEC22BO75396 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEC22BO75396 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEC22BO75396 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEC22BO75396 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEC22BO75396 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEC22BO75396 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEC22BO75396 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEC22BO75396 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEC22BO75396 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEC22BO75396 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEC22BO75396 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SEC22BO75396 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEC22BO75396 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEC22BO75396 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEC22BO75396 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEC22BO75396 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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SEC22BO75396 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SEC22BO75396 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SEC22BO75396 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SEC22BO75396 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SEC22BO75396 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SEC22BO75396 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SEC22BO75396 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SEC22BO75396 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SEC22BO75396 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SEC22BO75396 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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SEC22BO75396 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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SEC22BO75396 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SEC22BO75396 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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SEC22BO75396 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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SEC22BO75396 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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SEC22BO75396 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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SEC22BO75396 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SEC22BO75396 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SEC22BO75396 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SEC22BO75396 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SEC22BO75396 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SEC22BO75396 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SEC22BO75396 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SEC22BO75396 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SEC22BO75396 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SEC22BO75396 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SEC22BO75396 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SEC22BO75396 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SEC22BO75396 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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