Protein–RNA interactions for Protein: O60271

SPAG9, C-Jun-amino-terminal kinase-interacting protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPAG9O60271 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPAG9O60271 APBB3-205ENST00000412920 1455 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPAG9O60271 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPAG9O60271 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPAG9O60271 MEIKIN-205ENST00000616644 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPAG9O60271 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPAG9O60271 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPAG9O60271 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPAG9O60271 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPAG9O60271 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPAG9O60271 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPAG9O60271 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPAG9O60271 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPAG9O60271 SLC44A3-209ENST00000532427 1912 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPAG9O60271 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPAG9O60271 TOMM20L-201ENST00000360945 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPAG9O60271 AL357563.1-201ENST00000404728 395 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SPAG9O60271 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPAG9O60271 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SPAG9O60271 TNNT2-214ENST00000458432 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPAG9O60271 RPS25-202ENST00000527673 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPAG9O60271 AP000911.2-201ENST00000534330 502 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SPAG9O60271 EMP2-203ENST00000536829 781 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPAG9O60271 AC068397.2-201ENST00000558742 341 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPAG9O60271 NPTN-204ENST00000562924 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPAG9O60271 MT3-203ENST00000565838 421 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPAG9O60271 AC145207.8-201ENST00000580897 563 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPAG9O60271 PSMD5-208ENST00000625444 219 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPAG9O60271 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPAG9O60271 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SPAG9O60271 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPAG9O60271 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPAG9O60271 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPAG9O60271 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPAG9O60271 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPAG9O60271 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPAG9O60271 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPAG9O60271 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPAG9O60271 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPAG9O60271 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPAG9O60271 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SPAG9O60271 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPAG9O60271 METTL7B-202ENST00000614691 1368 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPAG9O60271 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPAG9O60271 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPAG9O60271 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPAG9O60271 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SPAG9O60271 TMPRSS3-202ENST00000398397 1342 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPAG9O60271 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPAG9O60271 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPAG9O60271 FERD3L-201ENST00000275461 640 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPAG9O60271 BX276092.5-201ENST00000439926 886 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPAG9O60271 Z99943.1-201ENST00000451545 718 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPAG9O60271 ALG1L6P-201ENST00000515248 758 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SPAG9O60271 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPAG9O60271 LINC02176-201ENST00000569104 598 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPAG9O60271 AC129507.4-201ENST00000570501 411 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPAG9O60271 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPAG9O60271 LINC00969-257ENST00000625632 898 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPAG9O60271 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPAG9O60271 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPAG9O60271 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPAG9O60271 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPAG9O60271 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPAG9O60271 MTMR9-202ENST00000526292 1960 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPAG9O60271 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPAG9O60271 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPAG9O60271 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPAG9O60271 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPAG9O60271 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPAG9O60271 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPAG9O60271 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPAG9O60271 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPAG9O60271 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPAG9O60271 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPAG9O60271 C8G-201ENST00000224181 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPAG9O60271 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SPAG9O60271 HLA-DMA-203ENST00000395305 777 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SPAG9O60271 C1QA-202ENST00000402322 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPAG9O60271 AC234644.1-201ENST00000406065 370 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SPAG9O60271 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPAG9O60271 AL354861.1-201ENST00000445213 355 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SPAG9O60271 ASNSD1-206ENST00000607062 968 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPAG9O60271 AC104333.4-201ENST00000632866 554 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPAG9O60271 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPAG9O60271 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPAG9O60271 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPAG9O60271 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPAG9O60271 MOGAT2-201ENST00000198801 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPAG9O60271 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPAG9O60271 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPAG9O60271 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPAG9O60271 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPAG9O60271 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SPAG9O60271 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPAG9O60271 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPAG9O60271 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPAG9O60271 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPAG9O60271 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPAG9O60271 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.2 ms