Protein–RNA interactions for Protein: O43889

CREB3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3O43889 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CREB3O43889 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CREB3O43889 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CREB3O43889 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CREB3O43889 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CREB3O43889 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CREB3O43889 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CREB3O43889 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CREB3O43889 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CREB3O43889 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CREB3O43889 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CREB3O43889 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CREB3O43889 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CREB3O43889 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CREB3O43889 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CREB3O43889 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CREB3O43889 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CREB3O43889 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CREB3O43889 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CREB3O43889 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CREB3O43889 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CREB3O43889 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CREB3O43889 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CREB3O43889 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CREB3O43889 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CREB3O43889 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CREB3O43889 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CREB3O43889 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CREB3O43889 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CREB3O43889 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CREB3O43889 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CREB3O43889 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CREB3O43889 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CREB3O43889 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CREB3O43889 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CREB3O43889 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CREB3O43889 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CREB3O43889 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CREB3O43889 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CREB3O43889 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CREB3O43889 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CREB3O43889 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CREB3O43889 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CREB3O43889 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CREB3O43889 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CREB3O43889 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CREB3O43889 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CREB3O43889 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CREB3O43889 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CREB3O43889 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CREB3O43889 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CREB3O43889 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CREB3O43889 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CREB3O43889 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CREB3O43889 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CREB3O43889 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CREB3O43889 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CREB3O43889 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CREB3O43889 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CREB3O43889 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CREB3O43889 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CREB3O43889 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CREB3O43889 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CREB3O43889 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CREB3O43889 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CREB3O43889 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CREB3O43889 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CREB3O43889 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CREB3O43889 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CREB3O43889 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CREB3O43889 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CREB3O43889 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CREB3O43889 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CREB3O43889 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CREB3O43889 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CREB3O43889 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CREB3O43889 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CREB3O43889 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CREB3O43889 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CREB3O43889 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CREB3O43889 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CREB3O43889 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CREB3O43889 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CREB3O43889 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CREB3O43889 CARHSP1-220ENST00000619881 2849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CREB3O43889 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CREB3O43889 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CREB3O43889 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CREB3O43889 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CREB3O43889 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CREB3O43889 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CREB3O43889 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CREB3O43889 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CREB3O43889 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CREB3O43889 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CREB3O43889 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CREB3O43889 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CREB3O43889 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CREB3O43889 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CREB3O43889 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms