Protein–RNA interactions for Protein: O15178

T, Brachyury protein, humanhuman

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Length 435 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TO15178 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TO15178 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TO15178 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
TO15178 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TO15178 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TO15178 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TO15178 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TO15178 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TO15178 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TO15178 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TO15178 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TO15178 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TO15178 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TO15178 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TO15178 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TO15178 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TO15178 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TO15178 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TO15178 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TO15178 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TO15178 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TO15178 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TO15178 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TO15178 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TO15178 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TO15178 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TO15178 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TO15178 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TO15178 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TO15178 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TO15178 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TO15178 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TO15178 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
TO15178 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
TO15178 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TO15178 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TO15178 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TO15178 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
TO15178 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
TO15178 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
TO15178 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TO15178 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TO15178 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
TO15178 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TO15178 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TO15178 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
TO15178 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TO15178 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
TO15178 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TO15178 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
TO15178 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
TO15178 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
TO15178 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
TO15178 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
TO15178 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TO15178 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TO15178 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TO15178 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
TO15178 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TO15178 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TO15178 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
TO15178 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
TO15178 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
TO15178 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
TO15178 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
TO15178 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
TO15178 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
TO15178 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
TO15178 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
TO15178 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TO15178 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
TO15178 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TO15178 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TO15178 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
TO15178 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TO15178 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
TO15178 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TO15178 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TO15178 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
TO15178 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TO15178 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TO15178 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TO15178 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TO15178 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TO15178 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TO15178 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TO15178 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TO15178 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TO15178 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TO15178 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TO15178 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
TO15178 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TO15178 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TO15178 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TO15178 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TO15178 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TO15178 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
TO15178 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TO15178 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TO15178 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
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