Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms