Protein–RNA interactions for Protein: C9JH25

PRRT4, Proline-rich transmembrane protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 899 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRT4C9JH25 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRRT4C9JH25 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRRT4C9JH25 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRRT4C9JH25 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRRT4C9JH25 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRRT4C9JH25 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRRT4C9JH25 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRRT4C9JH25 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRRT4C9JH25 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRRT4C9JH25 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRRT4C9JH25 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRRT4C9JH25 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRRT4C9JH25 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRRT4C9JH25 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRRT4C9JH25 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRRT4C9JH25 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PRRT4C9JH25 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRRT4C9JH25 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRRT4C9JH25 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRRT4C9JH25 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRRT4C9JH25 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRRT4C9JH25 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRRT4C9JH25 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PRRT4C9JH25 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRRT4C9JH25 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PRRT4C9JH25 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRRT4C9JH25 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PRRT4C9JH25 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRRT4C9JH25 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PRRT4C9JH25 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRRT4C9JH25 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PRRT4C9JH25 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRRT4C9JH25 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRRT4C9JH25 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRRT4C9JH25 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRRT4C9JH25 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRRT4C9JH25 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRRT4C9JH25 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRRT4C9JH25 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRRT4C9JH25 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRRT4C9JH25 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PRRT4C9JH25 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PRRT4C9JH25 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRRT4C9JH25 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRRT4C9JH25 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRRT4C9JH25 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRRT4C9JH25 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRRT4C9JH25 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PRRT4C9JH25 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRRT4C9JH25 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRRT4C9JH25 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRRT4C9JH25 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRRT4C9JH25 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRRT4C9JH25 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRRT4C9JH25 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRRT4C9JH25 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRRT4C9JH25 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRRT4C9JH25 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PRRT4C9JH25 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRRT4C9JH25 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRRT4C9JH25 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRRT4C9JH25 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRRT4C9JH25 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRRT4C9JH25 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRRT4C9JH25 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRRT4C9JH25 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRRT4C9JH25 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRRT4C9JH25 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRRT4C9JH25 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PRRT4C9JH25 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRRT4C9JH25 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PRRT4C9JH25 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRRT4C9JH25 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PRRT4C9JH25 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PRRT4C9JH25 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRRT4C9JH25 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRRT4C9JH25 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRRT4C9JH25 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PRRT4C9JH25 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PRRT4C9JH25 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PRRT4C9JH25 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRRT4C9JH25 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRRT4C9JH25 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRRT4C9JH25 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRRT4C9JH25 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRRT4C9JH25 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRRT4C9JH25 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRRT4C9JH25 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRRT4C9JH25 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRRT4C9JH25 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRRT4C9JH25 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRRT4C9JH25 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRRT4C9JH25 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRRT4C9JH25 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRRT4C9JH25 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRRT4C9JH25 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRRT4C9JH25 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PRRT4C9JH25 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
PRRT4C9JH25 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PRRT4C9JH25 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
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