Protein–RNA interactions for Protein: B5MD39

GGTLC3, Putative glutathione hydrolase light chain 3, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGTLC3B5MD39 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
GGTLC3B5MD39 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
GGTLC3B5MD39 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
GGTLC3B5MD39 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
GGTLC3B5MD39 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC11.66□□□□□ -0.54
GGTLC3B5MD39 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
GGTLC3B5MD39 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
GGTLC3B5MD39 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
GGTLC3B5MD39 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
GGTLC3B5MD39 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
GGTLC3B5MD39 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC11.66□□□□□ -0.54
GGTLC3B5MD39 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
GGTLC3B5MD39 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
GGTLC3B5MD39 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
GGTLC3B5MD39 FXR1-214ENST00000480918 1996 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
GGTLC3B5MD39 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
GGTLC3B5MD39 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
GGTLC3B5MD39 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
GGTLC3B5MD39 TRIM56-201ENST00000306085 10952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
GGTLC3B5MD39 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
GGTLC3B5MD39 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
GGTLC3B5MD39 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
GGTLC3B5MD39 ANK1-205ENST00000347528 8237 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
GGTLC3B5MD39 NFATC4-219ENST00000555167 4364 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
GGTLC3B5MD39 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
GGTLC3B5MD39 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
GGTLC3B5MD39 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
GGTLC3B5MD39 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
GGTLC3B5MD39 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
GGTLC3B5MD39 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
GGTLC3B5MD39 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
GGTLC3B5MD39 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
GGTLC3B5MD39 FAM129B-202ENST00000373314 3760 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
GGTLC3B5MD39 GNAS-215ENST00000371102 3438 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
GGTLC3B5MD39 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
GGTLC3B5MD39 AC027612.1-201ENST00000445234 2395 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
GGTLC3B5MD39 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
GGTLC3B5MD39 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
GGTLC3B5MD39 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
GGTLC3B5MD39 FIG4-201ENST00000230124 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
GGTLC3B5MD39 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
GGTLC3B5MD39 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
GGTLC3B5MD39 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
GGTLC3B5MD39 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
GGTLC3B5MD39 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
GGTLC3B5MD39 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
GGTLC3B5MD39 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
GGTLC3B5MD39 POLN-210ENST00000511885 3253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
GGTLC3B5MD39 WNT7B-201ENST00000339464 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
GGTLC3B5MD39 TNK2-202ENST00000381916 4223 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
GGTLC3B5MD39 DKFZP434A062-201ENST00000573103 5021 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
GGTLC3B5MD39 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
GGTLC3B5MD39 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
GGTLC3B5MD39 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
GGTLC3B5MD39 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
GGTLC3B5MD39 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
GGTLC3B5MD39 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
GGTLC3B5MD39 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
GGTLC3B5MD39 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
GGTLC3B5MD39 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
GGTLC3B5MD39 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
GGTLC3B5MD39 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
GGTLC3B5MD39 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
GGTLC3B5MD39 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
GGTLC3B5MD39 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
GGTLC3B5MD39 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
GGTLC3B5MD39 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
GGTLC3B5MD39 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
GGTLC3B5MD39 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
GGTLC3B5MD39 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
GGTLC3B5MD39 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
GGTLC3B5MD39 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
GGTLC3B5MD39 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
GGTLC3B5MD39 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
GGTLC3B5MD39 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
GGTLC3B5MD39 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
GGTLC3B5MD39 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
GGTLC3B5MD39 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
GGTLC3B5MD39 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
GGTLC3B5MD39 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
GGTLC3B5MD39 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
GGTLC3B5MD39 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
GGTLC3B5MD39 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
GGTLC3B5MD39 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
GGTLC3B5MD39 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
GGTLC3B5MD39 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
GGTLC3B5MD39 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
GGTLC3B5MD39 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
GGTLC3B5MD39 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
GGTLC3B5MD39 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
GGTLC3B5MD39 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
GGTLC3B5MD39 PRMT3-202ENST00000331079 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
GGTLC3B5MD39 PRR34-201ENST00000396008 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
GGTLC3B5MD39 ZBTB20-215ENST00000481632 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
GGTLC3B5MD39 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
GGTLC3B5MD39 GPER1-203ENST00000397092 2971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
GGTLC3B5MD39 PLCD1-204ENST00000463876 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
GGTLC3B5MD39 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
GGTLC3B5MD39 DHX16-202ENST00000376442 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
GGTLC3B5MD39 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.9 ms