Protein–RNA interactions for Protein: A2IDD5

CCDC78, Coiled-coil domain-containing protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC78A2IDD5 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC78A2IDD5 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC78A2IDD5 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC78A2IDD5 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC78A2IDD5 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC78A2IDD5 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC78A2IDD5 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC78A2IDD5 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC78A2IDD5 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC78A2IDD5 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC78A2IDD5 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC78A2IDD5 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC78A2IDD5 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC78A2IDD5 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC78A2IDD5 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC78A2IDD5 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC78A2IDD5 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC78A2IDD5 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC78A2IDD5 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC78A2IDD5 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC78A2IDD5 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC78A2IDD5 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC78A2IDD5 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC78A2IDD5 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC78A2IDD5 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC78A2IDD5 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC78A2IDD5 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC78A2IDD5 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC78A2IDD5 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC78A2IDD5 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC78A2IDD5 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC78A2IDD5 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC78A2IDD5 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC78A2IDD5 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC78A2IDD5 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC78A2IDD5 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC78A2IDD5 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC78A2IDD5 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC78A2IDD5 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC78A2IDD5 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC78A2IDD5 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC78A2IDD5 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC78A2IDD5 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC78A2IDD5 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC78A2IDD5 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC78A2IDD5 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC78A2IDD5 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC78A2IDD5 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC78A2IDD5 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC78A2IDD5 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC78A2IDD5 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC78A2IDD5 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC78A2IDD5 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC78A2IDD5 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC78A2IDD5 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC78A2IDD5 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC78A2IDD5 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC78A2IDD5 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC78A2IDD5 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC78A2IDD5 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC78A2IDD5 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC78A2IDD5 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC78A2IDD5 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC78A2IDD5 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC78A2IDD5 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC78A2IDD5 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC78A2IDD5 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC78A2IDD5 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC78A2IDD5 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC78A2IDD5 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC78A2IDD5 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC78A2IDD5 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC78A2IDD5 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC78A2IDD5 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC78A2IDD5 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC78A2IDD5 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC78A2IDD5 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC78A2IDD5 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC78A2IDD5 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC78A2IDD5 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC78A2IDD5 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC78A2IDD5 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC78A2IDD5 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC78A2IDD5 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC78A2IDD5 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC78A2IDD5 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC78A2IDD5 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC78A2IDD5 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC78A2IDD5 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC78A2IDD5 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC78A2IDD5 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC78A2IDD5 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC78A2IDD5 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC78A2IDD5 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC78A2IDD5 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC78A2IDD5 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC78A2IDD5 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC78A2IDD5 WNT7B-201ENST00000339464 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC78A2IDD5 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC78A2IDD5 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms