Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6K1

DNMT3A, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT3AQ9Y6K1 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DNMT3AQ9Y6K1 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DNMT3AQ9Y6K1 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
DNMT3AQ9Y6K1 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
DNMT3AQ9Y6K1 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
DNMT3AQ9Y6K1 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
DNMT3AQ9Y6K1 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
DNMT3AQ9Y6K1 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DNMT3AQ9Y6K1 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
DNMT3AQ9Y6K1 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DNMT3AQ9Y6K1 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DNMT3AQ9Y6K1 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DNMT3AQ9Y6K1 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DNMT3AQ9Y6K1 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DNMT3AQ9Y6K1 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DNMT3AQ9Y6K1 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DNMT3AQ9Y6K1 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DNMT3AQ9Y6K1 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DNMT3AQ9Y6K1 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DNMT3AQ9Y6K1 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DNMT3AQ9Y6K1 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DNMT3AQ9Y6K1 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DNMT3AQ9Y6K1 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DNMT3AQ9Y6K1 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DNMT3AQ9Y6K1 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DNMT3AQ9Y6K1 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DNMT3AQ9Y6K1 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DNMT3AQ9Y6K1 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DNMT3AQ9Y6K1 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DNMT3AQ9Y6K1 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DNMT3AQ9Y6K1 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DNMT3AQ9Y6K1 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DNMT3AQ9Y6K1 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DNMT3AQ9Y6K1 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DNMT3AQ9Y6K1 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DNMT3AQ9Y6K1 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DNMT3AQ9Y6K1 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DNMT3AQ9Y6K1 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DNMT3AQ9Y6K1 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DNMT3AQ9Y6K1 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DNMT3AQ9Y6K1 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DNMT3AQ9Y6K1 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DNMT3AQ9Y6K1 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DNMT3AQ9Y6K1 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DNMT3AQ9Y6K1 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DNMT3AQ9Y6K1 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DNMT3AQ9Y6K1 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DNMT3AQ9Y6K1 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DNMT3AQ9Y6K1 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DNMT3AQ9Y6K1 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DNMT3AQ9Y6K1 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DNMT3AQ9Y6K1 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DNMT3AQ9Y6K1 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DNMT3AQ9Y6K1 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DNMT3AQ9Y6K1 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DNMT3AQ9Y6K1 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DNMT3AQ9Y6K1 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DNMT3AQ9Y6K1 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DNMT3AQ9Y6K1 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DNMT3AQ9Y6K1 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DNMT3AQ9Y6K1 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DNMT3AQ9Y6K1 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DNMT3AQ9Y6K1 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DNMT3AQ9Y6K1 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DNMT3AQ9Y6K1 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DNMT3AQ9Y6K1 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DNMT3AQ9Y6K1 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DNMT3AQ9Y6K1 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DNMT3AQ9Y6K1 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DNMT3AQ9Y6K1 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DNMT3AQ9Y6K1 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DNMT3AQ9Y6K1 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DNMT3AQ9Y6K1 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DNMT3AQ9Y6K1 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DNMT3AQ9Y6K1 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DNMT3AQ9Y6K1 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DNMT3AQ9Y6K1 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DNMT3AQ9Y6K1 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DNMT3AQ9Y6K1 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DNMT3AQ9Y6K1 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DNMT3AQ9Y6K1 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
DNMT3AQ9Y6K1 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
DNMT3AQ9Y6K1 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DNMT3AQ9Y6K1 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DNMT3AQ9Y6K1 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DNMT3AQ9Y6K1 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
DNMT3AQ9Y6K1 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DNMT3AQ9Y6K1 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DNMT3AQ9Y6K1 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DNMT3AQ9Y6K1 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DNMT3AQ9Y6K1 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DNMT3AQ9Y6K1 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DNMT3AQ9Y6K1 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DNMT3AQ9Y6K1 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DNMT3AQ9Y6K1 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DNMT3AQ9Y6K1 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DNMT3AQ9Y6K1 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DNMT3AQ9Y6K1 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DNMT3AQ9Y6K1 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DNMT3AQ9Y6K1 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms