Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X1

SNX9, Sorting nexin-9, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX9Q9Y5X1 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SNX9Q9Y5X1 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SNX9Q9Y5X1 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SNX9Q9Y5X1 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SNX9Q9Y5X1 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SNX9Q9Y5X1 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SNX9Q9Y5X1 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SNX9Q9Y5X1 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SNX9Q9Y5X1 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SNX9Q9Y5X1 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SNX9Q9Y5X1 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SNX9Q9Y5X1 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SNX9Q9Y5X1 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SNX9Q9Y5X1 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SNX9Q9Y5X1 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SNX9Q9Y5X1 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SNX9Q9Y5X1 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SNX9Q9Y5X1 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SNX9Q9Y5X1 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SNX9Q9Y5X1 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SNX9Q9Y5X1 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SNX9Q9Y5X1 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SNX9Q9Y5X1 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
SNX9Q9Y5X1 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
SNX9Q9Y5X1 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
SNX9Q9Y5X1 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
SNX9Q9Y5X1 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SNX9Q9Y5X1 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SNX9Q9Y5X1 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SNX9Q9Y5X1 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SNX9Q9Y5X1 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SNX9Q9Y5X1 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SNX9Q9Y5X1 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SNX9Q9Y5X1 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SNX9Q9Y5X1 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SNX9Q9Y5X1 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SNX9Q9Y5X1 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SNX9Q9Y5X1 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SNX9Q9Y5X1 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SNX9Q9Y5X1 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SNX9Q9Y5X1 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SNX9Q9Y5X1 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SNX9Q9Y5X1 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SNX9Q9Y5X1 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SNX9Q9Y5X1 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SNX9Q9Y5X1 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SNX9Q9Y5X1 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SNX9Q9Y5X1 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SNX9Q9Y5X1 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SNX9Q9Y5X1 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SNX9Q9Y5X1 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SNX9Q9Y5X1 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SNX9Q9Y5X1 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SNX9Q9Y5X1 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SNX9Q9Y5X1 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SNX9Q9Y5X1 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SNX9Q9Y5X1 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SNX9Q9Y5X1 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SNX9Q9Y5X1 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SNX9Q9Y5X1 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SNX9Q9Y5X1 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SNX9Q9Y5X1 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SNX9Q9Y5X1 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SNX9Q9Y5X1 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SNX9Q9Y5X1 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SNX9Q9Y5X1 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SNX9Q9Y5X1 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SNX9Q9Y5X1 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SNX9Q9Y5X1 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SNX9Q9Y5X1 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SNX9Q9Y5X1 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SNX9Q9Y5X1 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SNX9Q9Y5X1 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SNX9Q9Y5X1 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SNX9Q9Y5X1 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SNX9Q9Y5X1 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SNX9Q9Y5X1 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SNX9Q9Y5X1 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SNX9Q9Y5X1 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SNX9Q9Y5X1 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SNX9Q9Y5X1 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SNX9Q9Y5X1 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SNX9Q9Y5X1 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SNX9Q9Y5X1 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SNX9Q9Y5X1 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SNX9Q9Y5X1 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SNX9Q9Y5X1 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SNX9Q9Y5X1 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SNX9Q9Y5X1 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
SNX9Q9Y5X1 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SNX9Q9Y5X1 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SNX9Q9Y5X1 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
SNX9Q9Y5X1 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SNX9Q9Y5X1 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SNX9Q9Y5X1 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SNX9Q9Y5X1 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SNX9Q9Y5X1 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SNX9Q9Y5X1 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SNX9Q9Y5X1 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SNX9Q9Y5X1 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms