Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W9

SNX11, Sorting nexin-11, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX11Q9Y5W9 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNX11Q9Y5W9 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNX11Q9Y5W9 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNX11Q9Y5W9 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNX11Q9Y5W9 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNX11Q9Y5W9 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNX11Q9Y5W9 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNX11Q9Y5W9 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNX11Q9Y5W9 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNX11Q9Y5W9 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNX11Q9Y5W9 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNX11Q9Y5W9 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNX11Q9Y5W9 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNX11Q9Y5W9 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SNX11Q9Y5W9 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNX11Q9Y5W9 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SNX11Q9Y5W9 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNX11Q9Y5W9 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNX11Q9Y5W9 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SNX11Q9Y5W9 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SNX11Q9Y5W9 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SNX11Q9Y5W9 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SNX11Q9Y5W9 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SNX11Q9Y5W9 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SNX11Q9Y5W9 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SNX11Q9Y5W9 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SNX11Q9Y5W9 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
SNX11Q9Y5W9 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNX11Q9Y5W9 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNX11Q9Y5W9 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNX11Q9Y5W9 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNX11Q9Y5W9 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNX11Q9Y5W9 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNX11Q9Y5W9 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNX11Q9Y5W9 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNX11Q9Y5W9 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNX11Q9Y5W9 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SNX11Q9Y5W9 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNX11Q9Y5W9 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNX11Q9Y5W9 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNX11Q9Y5W9 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNX11Q9Y5W9 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNX11Q9Y5W9 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNX11Q9Y5W9 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SNX11Q9Y5W9 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNX11Q9Y5W9 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNX11Q9Y5W9 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNX11Q9Y5W9 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNX11Q9Y5W9 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SNX11Q9Y5W9 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNX11Q9Y5W9 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNX11Q9Y5W9 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNX11Q9Y5W9 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNX11Q9Y5W9 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNX11Q9Y5W9 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNX11Q9Y5W9 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNX11Q9Y5W9 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNX11Q9Y5W9 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNX11Q9Y5W9 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNX11Q9Y5W9 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNX11Q9Y5W9 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNX11Q9Y5W9 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNX11Q9Y5W9 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNX11Q9Y5W9 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SNX11Q9Y5W9 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNX11Q9Y5W9 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNX11Q9Y5W9 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNX11Q9Y5W9 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SNX11Q9Y5W9 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SNX11Q9Y5W9 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SNX11Q9Y5W9 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNX11Q9Y5W9 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNX11Q9Y5W9 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNX11Q9Y5W9 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNX11Q9Y5W9 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNX11Q9Y5W9 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNX11Q9Y5W9 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNX11Q9Y5W9 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNX11Q9Y5W9 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNX11Q9Y5W9 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNX11Q9Y5W9 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNX11Q9Y5W9 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNX11Q9Y5W9 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SNX11Q9Y5W9 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNX11Q9Y5W9 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNX11Q9Y5W9 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNX11Q9Y5W9 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNX11Q9Y5W9 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNX11Q9Y5W9 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNX11Q9Y5W9 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNX11Q9Y5W9 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SNX11Q9Y5W9 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNX11Q9Y5W9 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNX11Q9Y5W9 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNX11Q9Y5W9 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNX11Q9Y5W9 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNX11Q9Y5W9 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNX11Q9Y5W9 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNX11Q9Y5W9 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNX11Q9Y5W9 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.3 ms