Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5P3

RAI2, Retinoic acid-induced protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAI2Q9Y5P3 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAI2Q9Y5P3 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAI2Q9Y5P3 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAI2Q9Y5P3 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAI2Q9Y5P3 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAI2Q9Y5P3 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAI2Q9Y5P3 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAI2Q9Y5P3 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAI2Q9Y5P3 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAI2Q9Y5P3 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAI2Q9Y5P3 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
RAI2Q9Y5P3 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAI2Q9Y5P3 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAI2Q9Y5P3 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAI2Q9Y5P3 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAI2Q9Y5P3 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAI2Q9Y5P3 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAI2Q9Y5P3 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
RAI2Q9Y5P3 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAI2Q9Y5P3 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAI2Q9Y5P3 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAI2Q9Y5P3 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAI2Q9Y5P3 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAI2Q9Y5P3 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAI2Q9Y5P3 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAI2Q9Y5P3 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAI2Q9Y5P3 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
RAI2Q9Y5P3 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAI2Q9Y5P3 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAI2Q9Y5P3 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAI2Q9Y5P3 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAI2Q9Y5P3 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAI2Q9Y5P3 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAI2Q9Y5P3 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
RAI2Q9Y5P3 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
RAI2Q9Y5P3 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAI2Q9Y5P3 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAI2Q9Y5P3 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAI2Q9Y5P3 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAI2Q9Y5P3 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAI2Q9Y5P3 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAI2Q9Y5P3 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAI2Q9Y5P3 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAI2Q9Y5P3 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAI2Q9Y5P3 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAI2Q9Y5P3 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAI2Q9Y5P3 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAI2Q9Y5P3 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAI2Q9Y5P3 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
RAI2Q9Y5P3 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAI2Q9Y5P3 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
RAI2Q9Y5P3 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAI2Q9Y5P3 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAI2Q9Y5P3 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAI2Q9Y5P3 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
RAI2Q9Y5P3 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAI2Q9Y5P3 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAI2Q9Y5P3 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAI2Q9Y5P3 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
RAI2Q9Y5P3 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAI2Q9Y5P3 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAI2Q9Y5P3 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAI2Q9Y5P3 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAI2Q9Y5P3 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAI2Q9Y5P3 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAI2Q9Y5P3 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAI2Q9Y5P3 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAI2Q9Y5P3 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAI2Q9Y5P3 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAI2Q9Y5P3 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAI2Q9Y5P3 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAI2Q9Y5P3 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAI2Q9Y5P3 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAI2Q9Y5P3 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAI2Q9Y5P3 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAI2Q9Y5P3 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAI2Q9Y5P3 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAI2Q9Y5P3 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAI2Q9Y5P3 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAI2Q9Y5P3 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAI2Q9Y5P3 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAI2Q9Y5P3 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAI2Q9Y5P3 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RAI2Q9Y5P3 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RAI2Q9Y5P3 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RAI2Q9Y5P3 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RAI2Q9Y5P3 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RAI2Q9Y5P3 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAI2Q9Y5P3 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAI2Q9Y5P3 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAI2Q9Y5P3 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAI2Q9Y5P3 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAI2Q9Y5P3 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
RAI2Q9Y5P3 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
RAI2Q9Y5P3 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAI2Q9Y5P3 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RAI2Q9Y5P3 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RAI2Q9Y5P3 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RAI2Q9Y5P3 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RAI2Q9Y5P3 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms