Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5K6

CD2AP, CD2-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD2APQ9Y5K6 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
CD2APQ9Y5K6 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
CD2APQ9Y5K6 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CD2APQ9Y5K6 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CD2APQ9Y5K6 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
CD2APQ9Y5K6 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CD2APQ9Y5K6 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CD2APQ9Y5K6 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
CD2APQ9Y5K6 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CD2APQ9Y5K6 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CD2APQ9Y5K6 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CD2APQ9Y5K6 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CD2APQ9Y5K6 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CD2APQ9Y5K6 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CD2APQ9Y5K6 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CD2APQ9Y5K6 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CD2APQ9Y5K6 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CD2APQ9Y5K6 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CD2APQ9Y5K6 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CD2APQ9Y5K6 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CD2APQ9Y5K6 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CD2APQ9Y5K6 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CD2APQ9Y5K6 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CD2APQ9Y5K6 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CD2APQ9Y5K6 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CD2APQ9Y5K6 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CD2APQ9Y5K6 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
CD2APQ9Y5K6 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CD2APQ9Y5K6 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CD2APQ9Y5K6 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CD2APQ9Y5K6 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CD2APQ9Y5K6 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CD2APQ9Y5K6 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CD2APQ9Y5K6 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
CD2APQ9Y5K6 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CD2APQ9Y5K6 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CD2APQ9Y5K6 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CD2APQ9Y5K6 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CD2APQ9Y5K6 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CD2APQ9Y5K6 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CD2APQ9Y5K6 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CD2APQ9Y5K6 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CD2APQ9Y5K6 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CD2APQ9Y5K6 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CD2APQ9Y5K6 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CD2APQ9Y5K6 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CD2APQ9Y5K6 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CD2APQ9Y5K6 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CD2APQ9Y5K6 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CD2APQ9Y5K6 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CD2APQ9Y5K6 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CD2APQ9Y5K6 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CD2APQ9Y5K6 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CD2APQ9Y5K6 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CD2APQ9Y5K6 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CD2APQ9Y5K6 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CD2APQ9Y5K6 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CD2APQ9Y5K6 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CD2APQ9Y5K6 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CD2APQ9Y5K6 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
CD2APQ9Y5K6 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CD2APQ9Y5K6 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CD2APQ9Y5K6 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
CD2APQ9Y5K6 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
CD2APQ9Y5K6 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
CD2APQ9Y5K6 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CD2APQ9Y5K6 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CD2APQ9Y5K6 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
CD2APQ9Y5K6 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CD2APQ9Y5K6 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CD2APQ9Y5K6 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CD2APQ9Y5K6 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CD2APQ9Y5K6 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CD2APQ9Y5K6 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CD2APQ9Y5K6 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CD2APQ9Y5K6 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CD2APQ9Y5K6 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CD2APQ9Y5K6 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
CD2APQ9Y5K6 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CD2APQ9Y5K6 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CD2APQ9Y5K6 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CD2APQ9Y5K6 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CD2APQ9Y5K6 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
CD2APQ9Y5K6 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CD2APQ9Y5K6 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CD2APQ9Y5K6 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
CD2APQ9Y5K6 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CD2APQ9Y5K6 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CD2APQ9Y5K6 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CD2APQ9Y5K6 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CD2APQ9Y5K6 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CD2APQ9Y5K6 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CD2APQ9Y5K6 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CD2APQ9Y5K6 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CD2APQ9Y5K6 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CD2APQ9Y5K6 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CD2APQ9Y5K6 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CD2APQ9Y5K6 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CD2APQ9Y5K6 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CD2APQ9Y5K6 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms