Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5H0

PCDHGA3, Protocadherin gamma-A3, humanhuman

Predictions only

Length 932 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHGA3Q9Y5H0 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PCDHGA3Q9Y5H0 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PCDHGA3Q9Y5H0 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PCDHGA3Q9Y5H0 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PCDHGA3Q9Y5H0 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PCDHGA3Q9Y5H0 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PCDHGA3Q9Y5H0 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PCDHGA3Q9Y5H0 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PCDHGA3Q9Y5H0 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PCDHGA3Q9Y5H0 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PCDHGA3Q9Y5H0 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PCDHGA3Q9Y5H0 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PCDHGA3Q9Y5H0 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PCDHGA3Q9Y5H0 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PCDHGA3Q9Y5H0 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PCDHGA3Q9Y5H0 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PCDHGA3Q9Y5H0 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PCDHGA3Q9Y5H0 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PCDHGA3Q9Y5H0 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PCDHGA3Q9Y5H0 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCDHGA3Q9Y5H0 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCDHGA3Q9Y5H0 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCDHGA3Q9Y5H0 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PCDHGA3Q9Y5H0 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCDHGA3Q9Y5H0 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCDHGA3Q9Y5H0 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCDHGA3Q9Y5H0 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCDHGA3Q9Y5H0 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCDHGA3Q9Y5H0 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
PCDHGA3Q9Y5H0 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCDHGA3Q9Y5H0 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCDHGA3Q9Y5H0 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCDHGA3Q9Y5H0 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCDHGA3Q9Y5H0 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCDHGA3Q9Y5H0 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCDHGA3Q9Y5H0 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCDHGA3Q9Y5H0 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCDHGA3Q9Y5H0 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCDHGA3Q9Y5H0 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCDHGA3Q9Y5H0 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCDHGA3Q9Y5H0 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCDHGA3Q9Y5H0 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCDHGA3Q9Y5H0 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCDHGA3Q9Y5H0 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCDHGA3Q9Y5H0 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCDHGA3Q9Y5H0 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCDHGA3Q9Y5H0 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCDHGA3Q9Y5H0 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCDHGA3Q9Y5H0 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PCDHGA3Q9Y5H0 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCDHGA3Q9Y5H0 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCDHGA3Q9Y5H0 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCDHGA3Q9Y5H0 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCDHGA3Q9Y5H0 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCDHGA3Q9Y5H0 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCDHGA3Q9Y5H0 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCDHGA3Q9Y5H0 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCDHGA3Q9Y5H0 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCDHGA3Q9Y5H0 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCDHGA3Q9Y5H0 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCDHGA3Q9Y5H0 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCDHGA3Q9Y5H0 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCDHGA3Q9Y5H0 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PCDHGA3Q9Y5H0 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCDHGA3Q9Y5H0 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCDHGA3Q9Y5H0 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCDHGA3Q9Y5H0 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCDHGA3Q9Y5H0 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCDHGA3Q9Y5H0 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCDHGA3Q9Y5H0 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCDHGA3Q9Y5H0 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PCDHGA3Q9Y5H0 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PCDHGA3Q9Y5H0 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PCDHGA3Q9Y5H0 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PCDHGA3Q9Y5H0 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PCDHGA3Q9Y5H0 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PCDHGA3Q9Y5H0 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PCDHGA3Q9Y5H0 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCDHGA3Q9Y5H0 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCDHGA3Q9Y5H0 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PCDHGA3Q9Y5H0 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCDHGA3Q9Y5H0 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCDHGA3Q9Y5H0 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCDHGA3Q9Y5H0 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCDHGA3Q9Y5H0 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCDHGA3Q9Y5H0 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PCDHGA3Q9Y5H0 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCDHGA3Q9Y5H0 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCDHGA3Q9Y5H0 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCDHGA3Q9Y5H0 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCDHGA3Q9Y5H0 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCDHGA3Q9Y5H0 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCDHGA3Q9Y5H0 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCDHGA3Q9Y5H0 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCDHGA3Q9Y5H0 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCDHGA3Q9Y5H0 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCDHGA3Q9Y5H0 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCDHGA3Q9Y5H0 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCDHGA3Q9Y5H0 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCDHGA3Q9Y5H0 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms