Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y535

POLR3H, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3HQ9Y535 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLR3HQ9Y535 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
POLR3HQ9Y535 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
POLR3HQ9Y535 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
POLR3HQ9Y535 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
POLR3HQ9Y535 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
POLR3HQ9Y535 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
POLR3HQ9Y535 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
POLR3HQ9Y535 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
POLR3HQ9Y535 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
POLR3HQ9Y535 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
POLR3HQ9Y535 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
POLR3HQ9Y535 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLR3HQ9Y535 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLR3HQ9Y535 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLR3HQ9Y535 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLR3HQ9Y535 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLR3HQ9Y535 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLR3HQ9Y535 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
POLR3HQ9Y535 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLR3HQ9Y535 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLR3HQ9Y535 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
POLR3HQ9Y535 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLR3HQ9Y535 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLR3HQ9Y535 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLR3HQ9Y535 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLR3HQ9Y535 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLR3HQ9Y535 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
POLR3HQ9Y535 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLR3HQ9Y535 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLR3HQ9Y535 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLR3HQ9Y535 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
POLR3HQ9Y535 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
POLR3HQ9Y535 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
POLR3HQ9Y535 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
POLR3HQ9Y535 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
POLR3HQ9Y535 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
POLR3HQ9Y535 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
POLR3HQ9Y535 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
POLR3HQ9Y535 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
POLR3HQ9Y535 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
POLR3HQ9Y535 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
POLR3HQ9Y535 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
POLR3HQ9Y535 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
POLR3HQ9Y535 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
POLR3HQ9Y535 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
POLR3HQ9Y535 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
POLR3HQ9Y535 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
POLR3HQ9Y535 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
POLR3HQ9Y535 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
POLR3HQ9Y535 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
POLR3HQ9Y535 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
POLR3HQ9Y535 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLR3HQ9Y535 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLR3HQ9Y535 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLR3HQ9Y535 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLR3HQ9Y535 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLR3HQ9Y535 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLR3HQ9Y535 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
POLR3HQ9Y535 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLR3HQ9Y535 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLR3HQ9Y535 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLR3HQ9Y535 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLR3HQ9Y535 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLR3HQ9Y535 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLR3HQ9Y535 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLR3HQ9Y535 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLR3HQ9Y535 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLR3HQ9Y535 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLR3HQ9Y535 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLR3HQ9Y535 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLR3HQ9Y535 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLR3HQ9Y535 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLR3HQ9Y535 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLR3HQ9Y535 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
POLR3HQ9Y535 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
POLR3HQ9Y535 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
POLR3HQ9Y535 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
POLR3HQ9Y535 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
POLR3HQ9Y535 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
POLR3HQ9Y535 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
POLR3HQ9Y535 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
POLR3HQ9Y535 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLR3HQ9Y535 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLR3HQ9Y535 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLR3HQ9Y535 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLR3HQ9Y535 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLR3HQ9Y535 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLR3HQ9Y535 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLR3HQ9Y535 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLR3HQ9Y535 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLR3HQ9Y535 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLR3HQ9Y535 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLR3HQ9Y535 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLR3HQ9Y535 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLR3HQ9Y535 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLR3HQ9Y535 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLR3HQ9Y535 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
POLR3HQ9Y535 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLR3HQ9Y535 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms