Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4B6

DCAF1, DDB1- and CUL4-associated factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,507 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF1Q9Y4B6 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.85■■■■■ 4.77
DCAF1Q9Y4B6 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.84■■■■■ 4.77
DCAF1Q9Y4B6 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.84■■■■■ 4.77
DCAF1Q9Y4B6 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC44.84■■■■■ 4.77
DCAF1Q9Y4B6 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC44.84■■■■■ 4.77
DCAF1Q9Y4B6 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC44.84■■■■■ 4.77
DCAF1Q9Y4B6 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC44.84■■■■■ 4.77
DCAF1Q9Y4B6 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.83■■■■■ 4.77
DCAF1Q9Y4B6 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC44.83■■■■■ 4.77
DCAF1Q9Y4B6 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC44.83■■■■■ 4.77
DCAF1Q9Y4B6 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.82■■■■■ 4.77
DCAF1Q9Y4B6 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.82■■■■■ 4.77
DCAF1Q9Y4B6 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.82■■■■■ 4.77
DCAF1Q9Y4B6 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.82■■■■■ 4.77
DCAF1Q9Y4B6 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.82■■■■■ 4.77
DCAF1Q9Y4B6 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC44.81■■■■■ 4.76
DCAF1Q9Y4B6 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC44.81■■■■■ 4.76
DCAF1Q9Y4B6 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.81■■■■■ 4.76
DCAF1Q9Y4B6 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC44.8■■■■■ 4.76
DCAF1Q9Y4B6 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC44.8■■■■■ 4.76
DCAF1Q9Y4B6 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.8■■■■■ 4.76
DCAF1Q9Y4B6 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.8■■■■■ 4.76
DCAF1Q9Y4B6 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC44.8■■■■■ 4.76
DCAF1Q9Y4B6 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC44.8■■■■■ 4.76
DCAF1Q9Y4B6 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC44.8■■■■■ 4.76
DCAF1Q9Y4B6 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC44.79■■■■■ 4.76
DCAF1Q9Y4B6 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC44.79■■■■■ 4.76
DCAF1Q9Y4B6 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC44.78■■■■■ 4.76
DCAF1Q9Y4B6 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.78■■■■■ 4.76
DCAF1Q9Y4B6 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC44.78■■■■■ 4.76
DCAF1Q9Y4B6 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC44.78■■■■■ 4.76
DCAF1Q9Y4B6 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.77■■■■■ 4.76
DCAF1Q9Y4B6 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC44.77■■■■■ 4.76
DCAF1Q9Y4B6 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC44.77■■■■■ 4.76
DCAF1Q9Y4B6 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC44.76■■■■■ 4.76
DCAF1Q9Y4B6 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC44.76■■■■■ 4.76
DCAF1Q9Y4B6 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC44.76■■■■■ 4.76
DCAF1Q9Y4B6 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC44.76■■■■■ 4.76
DCAF1Q9Y4B6 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC44.76■■■■■ 4.76
DCAF1Q9Y4B6 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC44.75■■■■■ 4.76
DCAF1Q9Y4B6 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.75■■■■■ 4.75
DCAF1Q9Y4B6 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.75■■■■■ 4.75
DCAF1Q9Y4B6 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.75■■■■■ 4.75
DCAF1Q9Y4B6 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC44.74■■■■■ 4.75
DCAF1Q9Y4B6 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.74■■■■■ 4.75
DCAF1Q9Y4B6 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC44.73■■■■■ 4.75
DCAF1Q9Y4B6 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.73■■■■■ 4.75
DCAF1Q9Y4B6 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.73■■■■■ 4.75
DCAF1Q9Y4B6 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC44.73■■■■■ 4.75
DCAF1Q9Y4B6 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC44.73■■■■■ 4.75
DCAF1Q9Y4B6 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC44.73■■■■■ 4.75
DCAF1Q9Y4B6 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC44.73■■■■■ 4.75
DCAF1Q9Y4B6 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC44.73■■■■■ 4.75
DCAF1Q9Y4B6 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC44.73■■■■■ 4.75
DCAF1Q9Y4B6 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC44.73■■■■■ 4.75
DCAF1Q9Y4B6 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.73■■■■■ 4.75
DCAF1Q9Y4B6 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC44.72■■■■■ 4.75
DCAF1Q9Y4B6 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC44.72■■■■■ 4.75
DCAF1Q9Y4B6 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC44.72■■■■■ 4.75
DCAF1Q9Y4B6 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.71■■■■■ 4.75
DCAF1Q9Y4B6 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC44.71■■■■■ 4.75
DCAF1Q9Y4B6 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC44.71■■■■■ 4.75
DCAF1Q9Y4B6 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.71■■■■■ 4.75
DCAF1Q9Y4B6 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.71■■■■■ 4.75
DCAF1Q9Y4B6 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC44.71■■■■■ 4.75
DCAF1Q9Y4B6 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC44.7■■■■■ 4.75
DCAF1Q9Y4B6 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC44.7■■■■■ 4.75
DCAF1Q9Y4B6 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC44.7■■■■■ 4.75
DCAF1Q9Y4B6 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC44.7■■■■■ 4.75
DCAF1Q9Y4B6 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC44.7■■■■■ 4.75
DCAF1Q9Y4B6 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC44.7■■■■■ 4.75
DCAF1Q9Y4B6 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.69■■■■■ 4.75
DCAF1Q9Y4B6 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC44.69■■■■■ 4.74
DCAF1Q9Y4B6 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC44.69■■■■■ 4.74
DCAF1Q9Y4B6 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC44.69■■■■■ 4.74
DCAF1Q9Y4B6 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.69■■■■■ 4.74
DCAF1Q9Y4B6 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC44.68■■■■■ 4.74
DCAF1Q9Y4B6 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC44.67■■■■■ 4.74
DCAF1Q9Y4B6 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC44.67■■■■■ 4.74
DCAF1Q9Y4B6 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.67■■■■■ 4.74
DCAF1Q9Y4B6 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.67■■■■■ 4.74
DCAF1Q9Y4B6 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.67■■■■■ 4.74
DCAF1Q9Y4B6 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC44.67■■■■■ 4.74
DCAF1Q9Y4B6 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC44.66■■■■■ 4.74
DCAF1Q9Y4B6 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC44.65■■■■■ 4.74
DCAF1Q9Y4B6 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC44.65■■■■■ 4.74
DCAF1Q9Y4B6 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.65■■■■■ 4.74
DCAF1Q9Y4B6 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.64■■■■■ 4.74
DCAF1Q9Y4B6 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.64■■■■■ 4.74
DCAF1Q9Y4B6 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC44.64■■■■■ 4.74
DCAF1Q9Y4B6 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC44.64■■■■■ 4.74
DCAF1Q9Y4B6 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC44.64■■■■■ 4.74
DCAF1Q9Y4B6 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.63■■■■■ 4.74
DCAF1Q9Y4B6 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.63■■■■■ 4.74
DCAF1Q9Y4B6 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC44.63■■■■■ 4.73
DCAF1Q9Y4B6 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC44.63■■■■■ 4.73
DCAF1Q9Y4B6 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC44.63■■■■■ 4.73
DCAF1Q9Y4B6 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.62■■■■■ 4.73
DCAF1Q9Y4B6 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.62■■■■■ 4.73
DCAF1Q9Y4B6 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.62■■■■■ 4.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms