Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y496

KIF3A, Kinesin-like protein KIF3A, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF3AQ9Y496 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
KIF3AQ9Y496 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
KIF3AQ9Y496 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
KIF3AQ9Y496 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
KIF3AQ9Y496 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
KIF3AQ9Y496 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
KIF3AQ9Y496 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
KIF3AQ9Y496 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
KIF3AQ9Y496 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
KIF3AQ9Y496 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
KIF3AQ9Y496 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
KIF3AQ9Y496 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
KIF3AQ9Y496 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
KIF3AQ9Y496 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
KIF3AQ9Y496 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
KIF3AQ9Y496 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
KIF3AQ9Y496 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
KIF3AQ9Y496 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
KIF3AQ9Y496 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
KIF3AQ9Y496 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
KIF3AQ9Y496 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
KIF3AQ9Y496 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
KIF3AQ9Y496 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
KIF3AQ9Y496 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
KIF3AQ9Y496 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
KIF3AQ9Y496 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
KIF3AQ9Y496 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
KIF3AQ9Y496 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
KIF3AQ9Y496 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
KIF3AQ9Y496 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
KIF3AQ9Y496 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
KIF3AQ9Y496 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
KIF3AQ9Y496 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
KIF3AQ9Y496 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
KIF3AQ9Y496 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
KIF3AQ9Y496 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
KIF3AQ9Y496 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
KIF3AQ9Y496 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
KIF3AQ9Y496 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
KIF3AQ9Y496 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
KIF3AQ9Y496 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
KIF3AQ9Y496 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
KIF3AQ9Y496 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
KIF3AQ9Y496 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
KIF3AQ9Y496 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
KIF3AQ9Y496 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
KIF3AQ9Y496 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
KIF3AQ9Y496 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
KIF3AQ9Y496 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
KIF3AQ9Y496 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
KIF3AQ9Y496 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
KIF3AQ9Y496 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
KIF3AQ9Y496 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
KIF3AQ9Y496 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
KIF3AQ9Y496 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
KIF3AQ9Y496 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
KIF3AQ9Y496 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
KIF3AQ9Y496 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
KIF3AQ9Y496 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
KIF3AQ9Y496 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
KIF3AQ9Y496 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
KIF3AQ9Y496 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
KIF3AQ9Y496 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
KIF3AQ9Y496 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
KIF3AQ9Y496 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
KIF3AQ9Y496 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
KIF3AQ9Y496 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
KIF3AQ9Y496 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
KIF3AQ9Y496 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
KIF3AQ9Y496 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
KIF3AQ9Y496 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
KIF3AQ9Y496 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
KIF3AQ9Y496 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
KIF3AQ9Y496 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
KIF3AQ9Y496 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
KIF3AQ9Y496 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
KIF3AQ9Y496 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
KIF3AQ9Y496 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
KIF3AQ9Y496 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
KIF3AQ9Y496 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
KIF3AQ9Y496 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
KIF3AQ9Y496 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
KIF3AQ9Y496 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
KIF3AQ9Y496 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
KIF3AQ9Y496 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
KIF3AQ9Y496 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
KIF3AQ9Y496 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
KIF3AQ9Y496 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
KIF3AQ9Y496 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
KIF3AQ9Y496 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
KIF3AQ9Y496 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
KIF3AQ9Y496 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
KIF3AQ9Y496 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
KIF3AQ9Y496 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
KIF3AQ9Y496 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
KIF3AQ9Y496 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
KIF3AQ9Y496 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
KIF3AQ9Y496 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
KIF3AQ9Y496 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
KIF3AQ9Y496 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms