Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y478

PRKAB1, 5'-AMP-activated protein kinase subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAB1Q9Y478 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PRKAB1Q9Y478 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRKAB1Q9Y478 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRKAB1Q9Y478 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRKAB1Q9Y478 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRKAB1Q9Y478 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRKAB1Q9Y478 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRKAB1Q9Y478 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRKAB1Q9Y478 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRKAB1Q9Y478 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRKAB1Q9Y478 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRKAB1Q9Y478 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRKAB1Q9Y478 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRKAB1Q9Y478 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PRKAB1Q9Y478 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PRKAB1Q9Y478 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PRKAB1Q9Y478 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PRKAB1Q9Y478 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRKAB1Q9Y478 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRKAB1Q9Y478 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRKAB1Q9Y478 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRKAB1Q9Y478 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRKAB1Q9Y478 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRKAB1Q9Y478 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRKAB1Q9Y478 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRKAB1Q9Y478 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRKAB1Q9Y478 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRKAB1Q9Y478 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRKAB1Q9Y478 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRKAB1Q9Y478 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRKAB1Q9Y478 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRKAB1Q9Y478 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRKAB1Q9Y478 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRKAB1Q9Y478 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRKAB1Q9Y478 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRKAB1Q9Y478 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRKAB1Q9Y478 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRKAB1Q9Y478 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRKAB1Q9Y478 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRKAB1Q9Y478 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRKAB1Q9Y478 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRKAB1Q9Y478 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PRKAB1Q9Y478 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRKAB1Q9Y478 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRKAB1Q9Y478 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRKAB1Q9Y478 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRKAB1Q9Y478 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRKAB1Q9Y478 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRKAB1Q9Y478 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRKAB1Q9Y478 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRKAB1Q9Y478 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRKAB1Q9Y478 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PRKAB1Q9Y478 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRKAB1Q9Y478 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRKAB1Q9Y478 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRKAB1Q9Y478 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRKAB1Q9Y478 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRKAB1Q9Y478 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRKAB1Q9Y478 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRKAB1Q9Y478 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PRKAB1Q9Y478 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRKAB1Q9Y478 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRKAB1Q9Y478 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PRKAB1Q9Y478 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PRKAB1Q9Y478 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRKAB1Q9Y478 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRKAB1Q9Y478 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRKAB1Q9Y478 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRKAB1Q9Y478 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRKAB1Q9Y478 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRKAB1Q9Y478 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRKAB1Q9Y478 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRKAB1Q9Y478 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRKAB1Q9Y478 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRKAB1Q9Y478 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRKAB1Q9Y478 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRKAB1Q9Y478 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRKAB1Q9Y478 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRKAB1Q9Y478 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRKAB1Q9Y478 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRKAB1Q9Y478 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRKAB1Q9Y478 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRKAB1Q9Y478 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRKAB1Q9Y478 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRKAB1Q9Y478 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRKAB1Q9Y478 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRKAB1Q9Y478 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRKAB1Q9Y478 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRKAB1Q9Y478 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRKAB1Q9Y478 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRKAB1Q9Y478 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRKAB1Q9Y478 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRKAB1Q9Y478 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRKAB1Q9Y478 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRKAB1Q9Y478 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRKAB1Q9Y478 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRKAB1Q9Y478 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRKAB1Q9Y478 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRKAB1Q9Y478 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRKAB1Q9Y478 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.3 ms