Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y466

NR2E1, Nuclear receptor subfamily 2 group E member 1, humanhuman

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR2E1Q9Y466 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NR2E1Q9Y466 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
NR2E1Q9Y466 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
NR2E1Q9Y466 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
NR2E1Q9Y466 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NR2E1Q9Y466 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NR2E1Q9Y466 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NR2E1Q9Y466 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NR2E1Q9Y466 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NR2E1Q9Y466 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NR2E1Q9Y466 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NR2E1Q9Y466 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NR2E1Q9Y466 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NR2E1Q9Y466 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NR2E1Q9Y466 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NR2E1Q9Y466 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NR2E1Q9Y466 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NR2E1Q9Y466 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NR2E1Q9Y466 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NR2E1Q9Y466 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NR2E1Q9Y466 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NR2E1Q9Y466 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NR2E1Q9Y466 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NR2E1Q9Y466 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NR2E1Q9Y466 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NR2E1Q9Y466 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NR2E1Q9Y466 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NR2E1Q9Y466 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NR2E1Q9Y466 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NR2E1Q9Y466 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NR2E1Q9Y466 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NR2E1Q9Y466 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NR2E1Q9Y466 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NR2E1Q9Y466 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NR2E1Q9Y466 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NR2E1Q9Y466 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
NR2E1Q9Y466 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NR2E1Q9Y466 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NR2E1Q9Y466 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NR2E1Q9Y466 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NR2E1Q9Y466 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NR2E1Q9Y466 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
NR2E1Q9Y466 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NR2E1Q9Y466 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NR2E1Q9Y466 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NR2E1Q9Y466 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
NR2E1Q9Y466 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NR2E1Q9Y466 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NR2E1Q9Y466 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NR2E1Q9Y466 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NR2E1Q9Y466 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NR2E1Q9Y466 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NR2E1Q9Y466 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
NR2E1Q9Y466 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NR2E1Q9Y466 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NR2E1Q9Y466 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NR2E1Q9Y466 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NR2E1Q9Y466 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NR2E1Q9Y466 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NR2E1Q9Y466 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NR2E1Q9Y466 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NR2E1Q9Y466 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NR2E1Q9Y466 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NR2E1Q9Y466 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NR2E1Q9Y466 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NR2E1Q9Y466 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NR2E1Q9Y466 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NR2E1Q9Y466 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NR2E1Q9Y466 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
NR2E1Q9Y466 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NR2E1Q9Y466 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NR2E1Q9Y466 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NR2E1Q9Y466 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NR2E1Q9Y466 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NR2E1Q9Y466 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NR2E1Q9Y466 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NR2E1Q9Y466 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NR2E1Q9Y466 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NR2E1Q9Y466 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NR2E1Q9Y466 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NR2E1Q9Y466 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
NR2E1Q9Y466 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NR2E1Q9Y466 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NR2E1Q9Y466 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NR2E1Q9Y466 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NR2E1Q9Y466 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NR2E1Q9Y466 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NR2E1Q9Y466 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NR2E1Q9Y466 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NR2E1Q9Y466 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NR2E1Q9Y466 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NR2E1Q9Y466 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NR2E1Q9Y466 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NR2E1Q9Y466 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NR2E1Q9Y466 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NR2E1Q9Y466 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NR2E1Q9Y466 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
NR2E1Q9Y466 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NR2E1Q9Y466 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
NR2E1Q9Y466 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms