Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3Y2

CHTOP, Chromatin target of PRMT1 protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHTOPQ9Y3Y2 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHTOPQ9Y3Y2 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHTOPQ9Y3Y2 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHTOPQ9Y3Y2 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHTOPQ9Y3Y2 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHTOPQ9Y3Y2 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHTOPQ9Y3Y2 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHTOPQ9Y3Y2 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHTOPQ9Y3Y2 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHTOPQ9Y3Y2 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHTOPQ9Y3Y2 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHTOPQ9Y3Y2 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHTOPQ9Y3Y2 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHTOPQ9Y3Y2 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHTOPQ9Y3Y2 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHTOPQ9Y3Y2 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHTOPQ9Y3Y2 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHTOPQ9Y3Y2 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHTOPQ9Y3Y2 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHTOPQ9Y3Y2 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHTOPQ9Y3Y2 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHTOPQ9Y3Y2 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHTOPQ9Y3Y2 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHTOPQ9Y3Y2 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHTOPQ9Y3Y2 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHTOPQ9Y3Y2 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHTOPQ9Y3Y2 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHTOPQ9Y3Y2 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHTOPQ9Y3Y2 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHTOPQ9Y3Y2 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHTOPQ9Y3Y2 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHTOPQ9Y3Y2 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHTOPQ9Y3Y2 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHTOPQ9Y3Y2 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHTOPQ9Y3Y2 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHTOPQ9Y3Y2 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHTOPQ9Y3Y2 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHTOPQ9Y3Y2 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHTOPQ9Y3Y2 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHTOPQ9Y3Y2 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHTOPQ9Y3Y2 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHTOPQ9Y3Y2 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHTOPQ9Y3Y2 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHTOPQ9Y3Y2 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHTOPQ9Y3Y2 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHTOPQ9Y3Y2 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CHTOPQ9Y3Y2 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHTOPQ9Y3Y2 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHTOPQ9Y3Y2 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHTOPQ9Y3Y2 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHTOPQ9Y3Y2 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHTOPQ9Y3Y2 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHTOPQ9Y3Y2 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHTOPQ9Y3Y2 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHTOPQ9Y3Y2 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHTOPQ9Y3Y2 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHTOPQ9Y3Y2 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHTOPQ9Y3Y2 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHTOPQ9Y3Y2 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHTOPQ9Y3Y2 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHTOPQ9Y3Y2 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHTOPQ9Y3Y2 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHTOPQ9Y3Y2 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHTOPQ9Y3Y2 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHTOPQ9Y3Y2 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHTOPQ9Y3Y2 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHTOPQ9Y3Y2 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHTOPQ9Y3Y2 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHTOPQ9Y3Y2 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHTOPQ9Y3Y2 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHTOPQ9Y3Y2 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHTOPQ9Y3Y2 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHTOPQ9Y3Y2 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHTOPQ9Y3Y2 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHTOPQ9Y3Y2 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHTOPQ9Y3Y2 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHTOPQ9Y3Y2 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHTOPQ9Y3Y2 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHTOPQ9Y3Y2 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHTOPQ9Y3Y2 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHTOPQ9Y3Y2 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHTOPQ9Y3Y2 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHTOPQ9Y3Y2 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHTOPQ9Y3Y2 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHTOPQ9Y3Y2 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHTOPQ9Y3Y2 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHTOPQ9Y3Y2 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHTOPQ9Y3Y2 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHTOPQ9Y3Y2 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHTOPQ9Y3Y2 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHTOPQ9Y3Y2 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHTOPQ9Y3Y2 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHTOPQ9Y3Y2 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHTOPQ9Y3Y2 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHTOPQ9Y3Y2 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHTOPQ9Y3Y2 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHTOPQ9Y3Y2 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHTOPQ9Y3Y2 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHTOPQ9Y3Y2 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CHTOPQ9Y3Y2 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms