Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3S2

ZNF330, Zinc finger protein 330, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF330Q9Y3S2 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
ZNF330Q9Y3S2 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC29.43■■■□□ 2.3
ZNF330Q9Y3S2 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
ZNF330Q9Y3S2 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
ZNF330Q9Y3S2 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
ZNF330Q9Y3S2 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
ZNF330Q9Y3S2 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
ZNF330Q9Y3S2 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
ZNF330Q9Y3S2 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
ZNF330Q9Y3S2 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
ZNF330Q9Y3S2 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
ZNF330Q9Y3S2 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
ZNF330Q9Y3S2 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
ZNF330Q9Y3S2 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
ZNF330Q9Y3S2 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
ZNF330Q9Y3S2 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC29.41■■■□□ 2.3
ZNF330Q9Y3S2 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
ZNF330Q9Y3S2 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
ZNF330Q9Y3S2 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
ZNF330Q9Y3S2 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
ZNF330Q9Y3S2 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
ZNF330Q9Y3S2 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
ZNF330Q9Y3S2 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
ZNF330Q9Y3S2 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
ZNF330Q9Y3S2 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
ZNF330Q9Y3S2 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
ZNF330Q9Y3S2 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
ZNF330Q9Y3S2 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
ZNF330Q9Y3S2 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
ZNF330Q9Y3S2 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
ZNF330Q9Y3S2 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
ZNF330Q9Y3S2 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
ZNF330Q9Y3S2 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
ZNF330Q9Y3S2 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
ZNF330Q9Y3S2 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
ZNF330Q9Y3S2 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
ZNF330Q9Y3S2 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
ZNF330Q9Y3S2 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
ZNF330Q9Y3S2 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
ZNF330Q9Y3S2 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
ZNF330Q9Y3S2 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
ZNF330Q9Y3S2 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
ZNF330Q9Y3S2 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
ZNF330Q9Y3S2 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
ZNF330Q9Y3S2 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
ZNF330Q9Y3S2 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
ZNF330Q9Y3S2 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
ZNF330Q9Y3S2 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
ZNF330Q9Y3S2 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
ZNF330Q9Y3S2 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
ZNF330Q9Y3S2 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
ZNF330Q9Y3S2 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
ZNF330Q9Y3S2 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
ZNF330Q9Y3S2 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
ZNF330Q9Y3S2 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
ZNF330Q9Y3S2 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
ZNF330Q9Y3S2 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
ZNF330Q9Y3S2 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
ZNF330Q9Y3S2 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
ZNF330Q9Y3S2 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
ZNF330Q9Y3S2 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
ZNF330Q9Y3S2 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
ZNF330Q9Y3S2 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
ZNF330Q9Y3S2 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
ZNF330Q9Y3S2 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
ZNF330Q9Y3S2 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
ZNF330Q9Y3S2 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
ZNF330Q9Y3S2 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
ZNF330Q9Y3S2 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
ZNF330Q9Y3S2 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
ZNF330Q9Y3S2 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
ZNF330Q9Y3S2 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
ZNF330Q9Y3S2 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
ZNF330Q9Y3S2 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
ZNF330Q9Y3S2 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
ZNF330Q9Y3S2 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
ZNF330Q9Y3S2 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
ZNF330Q9Y3S2 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
ZNF330Q9Y3S2 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
ZNF330Q9Y3S2 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
ZNF330Q9Y3S2 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
ZNF330Q9Y3S2 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC29.31■■■□□ 2.28
ZNF330Q9Y3S2 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
ZNF330Q9Y3S2 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
ZNF330Q9Y3S2 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
ZNF330Q9Y3S2 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
ZNF330Q9Y3S2 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC29.3■■■□□ 2.28
ZNF330Q9Y3S2 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
ZNF330Q9Y3S2 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
ZNF330Q9Y3S2 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
ZNF330Q9Y3S2 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
ZNF330Q9Y3S2 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
ZNF330Q9Y3S2 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
ZNF330Q9Y3S2 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
ZNF330Q9Y3S2 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
ZNF330Q9Y3S2 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
ZNF330Q9Y3S2 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
ZNF330Q9Y3S2 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
ZNF330Q9Y3S2 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
ZNF330Q9Y3S2 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms