Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3Q3

TMED3, Transmembrane emp24 domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED3Q9Y3Q3 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TMED3Q9Y3Q3 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
TMED3Q9Y3Q3 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
TMED3Q9Y3Q3 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
TMED3Q9Y3Q3 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.61
TMED3Q9Y3Q3 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
TMED3Q9Y3Q3 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
TMED3Q9Y3Q3 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
TMED3Q9Y3Q3 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
TMED3Q9Y3Q3 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TMED3Q9Y3Q3 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
TMED3Q9Y3Q3 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TMED3Q9Y3Q3 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TMED3Q9Y3Q3 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TMED3Q9Y3Q3 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TMED3Q9Y3Q3 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TMED3Q9Y3Q3 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TMED3Q9Y3Q3 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TMED3Q9Y3Q3 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TMED3Q9Y3Q3 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TMED3Q9Y3Q3 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TMED3Q9Y3Q3 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TMED3Q9Y3Q3 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TMED3Q9Y3Q3 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TMED3Q9Y3Q3 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TMED3Q9Y3Q3 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TMED3Q9Y3Q3 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TMED3Q9Y3Q3 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TMED3Q9Y3Q3 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TMED3Q9Y3Q3 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TMED3Q9Y3Q3 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TMED3Q9Y3Q3 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TMED3Q9Y3Q3 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TMED3Q9Y3Q3 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TMED3Q9Y3Q3 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TMED3Q9Y3Q3 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
TMED3Q9Y3Q3 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TMED3Q9Y3Q3 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TMED3Q9Y3Q3 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TMED3Q9Y3Q3 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TMED3Q9Y3Q3 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TMED3Q9Y3Q3 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
TMED3Q9Y3Q3 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TMED3Q9Y3Q3 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TMED3Q9Y3Q3 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TMED3Q9Y3Q3 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TMED3Q9Y3Q3 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TMED3Q9Y3Q3 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TMED3Q9Y3Q3 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TMED3Q9Y3Q3 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TMED3Q9Y3Q3 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TMED3Q9Y3Q3 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TMED3Q9Y3Q3 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TMED3Q9Y3Q3 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TMED3Q9Y3Q3 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TMED3Q9Y3Q3 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TMED3Q9Y3Q3 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TMED3Q9Y3Q3 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TMED3Q9Y3Q3 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TMED3Q9Y3Q3 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TMED3Q9Y3Q3 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TMED3Q9Y3Q3 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TMED3Q9Y3Q3 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
TMED3Q9Y3Q3 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TMED3Q9Y3Q3 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TMED3Q9Y3Q3 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TMED3Q9Y3Q3 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TMED3Q9Y3Q3 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TMED3Q9Y3Q3 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TMED3Q9Y3Q3 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TMED3Q9Y3Q3 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TMED3Q9Y3Q3 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
TMED3Q9Y3Q3 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TMED3Q9Y3Q3 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TMED3Q9Y3Q3 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TMED3Q9Y3Q3 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
TMED3Q9Y3Q3 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TMED3Q9Y3Q3 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TMED3Q9Y3Q3 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TMED3Q9Y3Q3 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TMED3Q9Y3Q3 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TMED3Q9Y3Q3 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
TMED3Q9Y3Q3 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
TMED3Q9Y3Q3 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMED3Q9Y3Q3 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMED3Q9Y3Q3 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
TMED3Q9Y3Q3 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMED3Q9Y3Q3 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMED3Q9Y3Q3 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMED3Q9Y3Q3 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMED3Q9Y3Q3 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMED3Q9Y3Q3 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMED3Q9Y3Q3 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMED3Q9Y3Q3 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMED3Q9Y3Q3 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
TMED3Q9Y3Q3 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMED3Q9Y3Q3 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMED3Q9Y3Q3 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMED3Q9Y3Q3 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMED3Q9Y3Q3 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms