Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3F1

Putative TAP2-associated 6.5 kDa polypeptide, humanhuman

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Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9Y3F1 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Q9Y3F1 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Q9Y3F1 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Q9Y3F1 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Q9Y3F1 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Q9Y3F1 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Q9Y3F1 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Q9Y3F1 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Q9Y3F1 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Q9Y3F1 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Q9Y3F1 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Q9Y3F1 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Q9Y3F1 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Q9Y3F1 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Q9Y3F1 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Q9Y3F1 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Q9Y3F1 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Q9Y3F1 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Q9Y3F1 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Q9Y3F1 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Q9Y3F1 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Q9Y3F1 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Q9Y3F1 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Q9Y3F1 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Q9Y3F1 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Q9Y3F1 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Q9Y3F1 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Q9Y3F1 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Q9Y3F1 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Q9Y3F1 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Q9Y3F1 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Q9Y3F1 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Q9Y3F1 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Q9Y3F1 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Q9Y3F1 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Q9Y3F1 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Q9Y3F1 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Q9Y3F1 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Q9Y3F1 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Q9Y3F1 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Q9Y3F1 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Q9Y3F1 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Q9Y3F1 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Q9Y3F1 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Q9Y3F1 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Q9Y3F1 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Q9Y3F1 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Q9Y3F1 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Q9Y3F1 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Q9Y3F1 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Q9Y3F1 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Q9Y3F1 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Q9Y3F1 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Q9Y3F1 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Q9Y3F1 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Q9Y3F1 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Q9Y3F1 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Q9Y3F1 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Q9Y3F1 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Q9Y3F1 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Q9Y3F1 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Q9Y3F1 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Q9Y3F1 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Q9Y3F1 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Q9Y3F1 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Q9Y3F1 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Q9Y3F1 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Q9Y3F1 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Q9Y3F1 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Q9Y3F1 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Q9Y3F1 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Q9Y3F1 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Q9Y3F1 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Q9Y3F1 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Q9Y3F1 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Q9Y3F1 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Q9Y3F1 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Q9Y3F1 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Q9Y3F1 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Q9Y3F1 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Q9Y3F1 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Q9Y3F1 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Q9Y3F1 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Q9Y3F1 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Q9Y3F1 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Q9Y3F1 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Q9Y3F1 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Q9Y3F1 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Q9Y3F1 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Q9Y3F1 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Q9Y3F1 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Q9Y3F1 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Q9Y3F1 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Q9Y3F1 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Q9Y3F1 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Q9Y3F1 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Q9Y3F1 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Q9Y3F1 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Q9Y3F1 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Q9Y3F1 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
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