Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3C5

RNF11, RING finger protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF11Q9Y3C5 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF11Q9Y3C5 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF11Q9Y3C5 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RNF11Q9Y3C5 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RNF11Q9Y3C5 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RNF11Q9Y3C5 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RNF11Q9Y3C5 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RNF11Q9Y3C5 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RNF11Q9Y3C5 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RNF11Q9Y3C5 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RNF11Q9Y3C5 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RNF11Q9Y3C5 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RNF11Q9Y3C5 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RNF11Q9Y3C5 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RNF11Q9Y3C5 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RNF11Q9Y3C5 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RNF11Q9Y3C5 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RNF11Q9Y3C5 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RNF11Q9Y3C5 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RNF11Q9Y3C5 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RNF11Q9Y3C5 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RNF11Q9Y3C5 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RNF11Q9Y3C5 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RNF11Q9Y3C5 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RNF11Q9Y3C5 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RNF11Q9Y3C5 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RNF11Q9Y3C5 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RNF11Q9Y3C5 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
RNF11Q9Y3C5 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RNF11Q9Y3C5 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RNF11Q9Y3C5 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RNF11Q9Y3C5 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RNF11Q9Y3C5 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RNF11Q9Y3C5 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RNF11Q9Y3C5 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RNF11Q9Y3C5 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RNF11Q9Y3C5 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RNF11Q9Y3C5 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RNF11Q9Y3C5 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RNF11Q9Y3C5 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RNF11Q9Y3C5 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RNF11Q9Y3C5 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RNF11Q9Y3C5 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RNF11Q9Y3C5 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RNF11Q9Y3C5 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RNF11Q9Y3C5 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RNF11Q9Y3C5 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RNF11Q9Y3C5 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RNF11Q9Y3C5 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RNF11Q9Y3C5 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RNF11Q9Y3C5 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RNF11Q9Y3C5 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RNF11Q9Y3C5 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RNF11Q9Y3C5 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RNF11Q9Y3C5 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RNF11Q9Y3C5 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RNF11Q9Y3C5 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RNF11Q9Y3C5 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
RNF11Q9Y3C5 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RNF11Q9Y3C5 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RNF11Q9Y3C5 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RNF11Q9Y3C5 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RNF11Q9Y3C5 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RNF11Q9Y3C5 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RNF11Q9Y3C5 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RNF11Q9Y3C5 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RNF11Q9Y3C5 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RNF11Q9Y3C5 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RNF11Q9Y3C5 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RNF11Q9Y3C5 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RNF11Q9Y3C5 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RNF11Q9Y3C5 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RNF11Q9Y3C5 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
RNF11Q9Y3C5 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
RNF11Q9Y3C5 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RNF11Q9Y3C5 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RNF11Q9Y3C5 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RNF11Q9Y3C5 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RNF11Q9Y3C5 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RNF11Q9Y3C5 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RNF11Q9Y3C5 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RNF11Q9Y3C5 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RNF11Q9Y3C5 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RNF11Q9Y3C5 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RNF11Q9Y3C5 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RNF11Q9Y3C5 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RNF11Q9Y3C5 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RNF11Q9Y3C5 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RNF11Q9Y3C5 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RNF11Q9Y3C5 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RNF11Q9Y3C5 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RNF11Q9Y3C5 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RNF11Q9Y3C5 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RNF11Q9Y3C5 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RNF11Q9Y3C5 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RNF11Q9Y3C5 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RNF11Q9Y3C5 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RNF11Q9Y3C5 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RNF11Q9Y3C5 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
RNF11Q9Y3C5 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms