Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2Y8

PRG3, Proteoglycan 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG3Q9Y2Y8 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRG3Q9Y2Y8 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRG3Q9Y2Y8 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRG3Q9Y2Y8 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRG3Q9Y2Y8 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRG3Q9Y2Y8 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRG3Q9Y2Y8 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRG3Q9Y2Y8 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRG3Q9Y2Y8 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRG3Q9Y2Y8 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRG3Q9Y2Y8 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRG3Q9Y2Y8 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRG3Q9Y2Y8 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRG3Q9Y2Y8 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRG3Q9Y2Y8 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRG3Q9Y2Y8 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRG3Q9Y2Y8 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRG3Q9Y2Y8 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRG3Q9Y2Y8 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRG3Q9Y2Y8 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
PRG3Q9Y2Y8 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRG3Q9Y2Y8 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
PRG3Q9Y2Y8 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRG3Q9Y2Y8 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRG3Q9Y2Y8 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRG3Q9Y2Y8 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
PRG3Q9Y2Y8 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRG3Q9Y2Y8 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
PRG3Q9Y2Y8 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRG3Q9Y2Y8 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRG3Q9Y2Y8 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRG3Q9Y2Y8 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRG3Q9Y2Y8 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRG3Q9Y2Y8 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRG3Q9Y2Y8 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRG3Q9Y2Y8 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRG3Q9Y2Y8 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRG3Q9Y2Y8 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRG3Q9Y2Y8 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRG3Q9Y2Y8 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRG3Q9Y2Y8 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRG3Q9Y2Y8 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRG3Q9Y2Y8 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRG3Q9Y2Y8 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRG3Q9Y2Y8 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRG3Q9Y2Y8 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRG3Q9Y2Y8 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRG3Q9Y2Y8 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRG3Q9Y2Y8 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRG3Q9Y2Y8 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRG3Q9Y2Y8 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRG3Q9Y2Y8 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRG3Q9Y2Y8 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PRG3Q9Y2Y8 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PRG3Q9Y2Y8 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PRG3Q9Y2Y8 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PRG3Q9Y2Y8 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PRG3Q9Y2Y8 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PRG3Q9Y2Y8 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PRG3Q9Y2Y8 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PRG3Q9Y2Y8 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PRG3Q9Y2Y8 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRG3Q9Y2Y8 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRG3Q9Y2Y8 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRG3Q9Y2Y8 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRG3Q9Y2Y8 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRG3Q9Y2Y8 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRG3Q9Y2Y8 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRG3Q9Y2Y8 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRG3Q9Y2Y8 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRG3Q9Y2Y8 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRG3Q9Y2Y8 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRG3Q9Y2Y8 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRG3Q9Y2Y8 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRG3Q9Y2Y8 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRG3Q9Y2Y8 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRG3Q9Y2Y8 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRG3Q9Y2Y8 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRG3Q9Y2Y8 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
PRG3Q9Y2Y8 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRG3Q9Y2Y8 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRG3Q9Y2Y8 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRG3Q9Y2Y8 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRG3Q9Y2Y8 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRG3Q9Y2Y8 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRG3Q9Y2Y8 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRG3Q9Y2Y8 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRG3Q9Y2Y8 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRG3Q9Y2Y8 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
PRG3Q9Y2Y8 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRG3Q9Y2Y8 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRG3Q9Y2Y8 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRG3Q9Y2Y8 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRG3Q9Y2Y8 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRG3Q9Y2Y8 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRG3Q9Y2Y8 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRG3Q9Y2Y8 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRG3Q9Y2Y8 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRG3Q9Y2Y8 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRG3Q9Y2Y8 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms