Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2I7

PIKFYVE, 1-phosphatidylinositol 3-phosphate 5-kinase, humanhuman

Predictions only

Length 2,098 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIKFYVEQ9Y2I7 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PIKFYVEQ9Y2I7 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PIKFYVEQ9Y2I7 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PIKFYVEQ9Y2I7 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PIKFYVEQ9Y2I7 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PIKFYVEQ9Y2I7 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PIKFYVEQ9Y2I7 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PIKFYVEQ9Y2I7 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PIKFYVEQ9Y2I7 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PIKFYVEQ9Y2I7 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PIKFYVEQ9Y2I7 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PIKFYVEQ9Y2I7 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PIKFYVEQ9Y2I7 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PIKFYVEQ9Y2I7 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PIKFYVEQ9Y2I7 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PIKFYVEQ9Y2I7 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PIKFYVEQ9Y2I7 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PIKFYVEQ9Y2I7 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PIKFYVEQ9Y2I7 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PIKFYVEQ9Y2I7 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PIKFYVEQ9Y2I7 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PIKFYVEQ9Y2I7 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PIKFYVEQ9Y2I7 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PIKFYVEQ9Y2I7 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PIKFYVEQ9Y2I7 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PIKFYVEQ9Y2I7 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PIKFYVEQ9Y2I7 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PIKFYVEQ9Y2I7 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PIKFYVEQ9Y2I7 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PIKFYVEQ9Y2I7 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PIKFYVEQ9Y2I7 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PIKFYVEQ9Y2I7 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PIKFYVEQ9Y2I7 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PIKFYVEQ9Y2I7 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PIKFYVEQ9Y2I7 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PIKFYVEQ9Y2I7 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PIKFYVEQ9Y2I7 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PIKFYVEQ9Y2I7 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PIKFYVEQ9Y2I7 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PIKFYVEQ9Y2I7 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PIKFYVEQ9Y2I7 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PIKFYVEQ9Y2I7 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PIKFYVEQ9Y2I7 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PIKFYVEQ9Y2I7 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PIKFYVEQ9Y2I7 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PIKFYVEQ9Y2I7 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PIKFYVEQ9Y2I7 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PIKFYVEQ9Y2I7 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
PIKFYVEQ9Y2I7 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
PIKFYVEQ9Y2I7 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PIKFYVEQ9Y2I7 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PIKFYVEQ9Y2I7 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PIKFYVEQ9Y2I7 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PIKFYVEQ9Y2I7 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PIKFYVEQ9Y2I7 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PIKFYVEQ9Y2I7 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PIKFYVEQ9Y2I7 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PIKFYVEQ9Y2I7 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PIKFYVEQ9Y2I7 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PIKFYVEQ9Y2I7 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PIKFYVEQ9Y2I7 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PIKFYVEQ9Y2I7 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PIKFYVEQ9Y2I7 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PIKFYVEQ9Y2I7 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PIKFYVEQ9Y2I7 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PIKFYVEQ9Y2I7 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PIKFYVEQ9Y2I7 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PIKFYVEQ9Y2I7 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PIKFYVEQ9Y2I7 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PIKFYVEQ9Y2I7 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PIKFYVEQ9Y2I7 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PIKFYVEQ9Y2I7 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PIKFYVEQ9Y2I7 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PIKFYVEQ9Y2I7 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PIKFYVEQ9Y2I7 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PIKFYVEQ9Y2I7 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PIKFYVEQ9Y2I7 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PIKFYVEQ9Y2I7 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PIKFYVEQ9Y2I7 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PIKFYVEQ9Y2I7 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PIKFYVEQ9Y2I7 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PIKFYVEQ9Y2I7 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PIKFYVEQ9Y2I7 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PIKFYVEQ9Y2I7 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PIKFYVEQ9Y2I7 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PIKFYVEQ9Y2I7 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PIKFYVEQ9Y2I7 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PIKFYVEQ9Y2I7 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PIKFYVEQ9Y2I7 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PIKFYVEQ9Y2I7 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PIKFYVEQ9Y2I7 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PIKFYVEQ9Y2I7 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PIKFYVEQ9Y2I7 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PIKFYVEQ9Y2I7 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PIKFYVEQ9Y2I7 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PIKFYVEQ9Y2I7 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PIKFYVEQ9Y2I7 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PIKFYVEQ9Y2I7 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PIKFYVEQ9Y2I7 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PIKFYVEQ9Y2I7 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms