Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y262

EIF3L, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit L, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF3LQ9Y262 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EIF3LQ9Y262 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EIF3LQ9Y262 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EIF3LQ9Y262 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EIF3LQ9Y262 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EIF3LQ9Y262 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EIF3LQ9Y262 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
EIF3LQ9Y262 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EIF3LQ9Y262 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EIF3LQ9Y262 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EIF3LQ9Y262 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EIF3LQ9Y262 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EIF3LQ9Y262 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EIF3LQ9Y262 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EIF3LQ9Y262 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EIF3LQ9Y262 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EIF3LQ9Y262 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EIF3LQ9Y262 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EIF3LQ9Y262 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EIF3LQ9Y262 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EIF3LQ9Y262 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EIF3LQ9Y262 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EIF3LQ9Y262 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EIF3LQ9Y262 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EIF3LQ9Y262 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EIF3LQ9Y262 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EIF3LQ9Y262 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
EIF3LQ9Y262 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EIF3LQ9Y262 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EIF3LQ9Y262 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EIF3LQ9Y262 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EIF3LQ9Y262 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EIF3LQ9Y262 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EIF3LQ9Y262 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EIF3LQ9Y262 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EIF3LQ9Y262 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
EIF3LQ9Y262 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
EIF3LQ9Y262 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EIF3LQ9Y262 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EIF3LQ9Y262 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
EIF3LQ9Y262 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EIF3LQ9Y262 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EIF3LQ9Y262 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EIF3LQ9Y262 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EIF3LQ9Y262 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EIF3LQ9Y262 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EIF3LQ9Y262 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EIF3LQ9Y262 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EIF3LQ9Y262 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EIF3LQ9Y262 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EIF3LQ9Y262 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
EIF3LQ9Y262 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EIF3LQ9Y262 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
EIF3LQ9Y262 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EIF3LQ9Y262 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EIF3LQ9Y262 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EIF3LQ9Y262 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EIF3LQ9Y262 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EIF3LQ9Y262 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EIF3LQ9Y262 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EIF3LQ9Y262 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EIF3LQ9Y262 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EIF3LQ9Y262 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EIF3LQ9Y262 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EIF3LQ9Y262 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EIF3LQ9Y262 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EIF3LQ9Y262 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EIF3LQ9Y262 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EIF3LQ9Y262 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EIF3LQ9Y262 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EIF3LQ9Y262 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EIF3LQ9Y262 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EIF3LQ9Y262 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EIF3LQ9Y262 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EIF3LQ9Y262 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EIF3LQ9Y262 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EIF3LQ9Y262 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EIF3LQ9Y262 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EIF3LQ9Y262 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EIF3LQ9Y262 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EIF3LQ9Y262 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
EIF3LQ9Y262 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EIF3LQ9Y262 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EIF3LQ9Y262 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EIF3LQ9Y262 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EIF3LQ9Y262 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EIF3LQ9Y262 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EIF3LQ9Y262 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
EIF3LQ9Y262 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
EIF3LQ9Y262 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
EIF3LQ9Y262 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
EIF3LQ9Y262 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EIF3LQ9Y262 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EIF3LQ9Y262 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EIF3LQ9Y262 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EIF3LQ9Y262 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EIF3LQ9Y262 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EIF3LQ9Y262 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EIF3LQ9Y262 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EIF3LQ9Y262 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms