Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y244

POMP, Proteasome maturation protein, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POMPQ9Y244 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
POMPQ9Y244 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
POMPQ9Y244 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
POMPQ9Y244 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
POMPQ9Y244 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
POMPQ9Y244 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
POMPQ9Y244 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
POMPQ9Y244 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
POMPQ9Y244 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
POMPQ9Y244 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
POMPQ9Y244 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
POMPQ9Y244 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
POMPQ9Y244 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
POMPQ9Y244 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
POMPQ9Y244 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
POMPQ9Y244 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
POMPQ9Y244 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
POMPQ9Y244 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
POMPQ9Y244 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
POMPQ9Y244 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
POMPQ9Y244 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
POMPQ9Y244 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
POMPQ9Y244 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
POMPQ9Y244 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
POMPQ9Y244 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
POMPQ9Y244 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
POMPQ9Y244 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
POMPQ9Y244 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
POMPQ9Y244 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
POMPQ9Y244 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
POMPQ9Y244 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
POMPQ9Y244 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
POMPQ9Y244 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
POMPQ9Y244 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
POMPQ9Y244 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
POMPQ9Y244 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
POMPQ9Y244 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
POMPQ9Y244 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
POMPQ9Y244 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
POMPQ9Y244 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
POMPQ9Y244 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
POMPQ9Y244 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
POMPQ9Y244 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
POMPQ9Y244 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
POMPQ9Y244 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
POMPQ9Y244 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
POMPQ9Y244 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
POMPQ9Y244 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
POMPQ9Y244 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
POMPQ9Y244 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
POMPQ9Y244 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
POMPQ9Y244 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
POMPQ9Y244 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
POMPQ9Y244 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
POMPQ9Y244 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
POMPQ9Y244 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
POMPQ9Y244 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
POMPQ9Y244 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
POMPQ9Y244 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
POMPQ9Y244 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
POMPQ9Y244 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
POMPQ9Y244 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
POMPQ9Y244 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
POMPQ9Y244 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
POMPQ9Y244 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
POMPQ9Y244 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
POMPQ9Y244 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
POMPQ9Y244 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
POMPQ9Y244 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
POMPQ9Y244 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
POMPQ9Y244 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
POMPQ9Y244 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
POMPQ9Y244 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
POMPQ9Y244 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
POMPQ9Y244 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
POMPQ9Y244 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
POMPQ9Y244 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
POMPQ9Y244 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
POMPQ9Y244 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
POMPQ9Y244 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
POMPQ9Y244 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
POMPQ9Y244 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
POMPQ9Y244 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
POMPQ9Y244 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
POMPQ9Y244 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
POMPQ9Y244 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
POMPQ9Y244 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
POMPQ9Y244 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
POMPQ9Y244 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
POMPQ9Y244 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
POMPQ9Y244 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
POMPQ9Y244 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
POMPQ9Y244 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
POMPQ9Y244 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
POMPQ9Y244 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
POMPQ9Y244 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
POMPQ9Y244 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
POMPQ9Y244 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
POMPQ9Y244 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
POMPQ9Y244 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms