Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPZ3

HPS5, Hermansky-Pudlak syndrome 5 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS5Q9UPZ3 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
HPS5Q9UPZ3 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
HPS5Q9UPZ3 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
HPS5Q9UPZ3 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
HPS5Q9UPZ3 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC27.55■■■□□ 2
HPS5Q9UPZ3 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
HPS5Q9UPZ3 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
HPS5Q9UPZ3 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
HPS5Q9UPZ3 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
HPS5Q9UPZ3 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
HPS5Q9UPZ3 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
HPS5Q9UPZ3 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC27.54■■■□□ 2
HPS5Q9UPZ3 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC27.54■■■□□ 2
HPS5Q9UPZ3 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
HPS5Q9UPZ3 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
HPS5Q9UPZ3 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
HPS5Q9UPZ3 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
HPS5Q9UPZ3 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
HPS5Q9UPZ3 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
HPS5Q9UPZ3 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
HPS5Q9UPZ3 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
HPS5Q9UPZ3 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
HPS5Q9UPZ3 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
HPS5Q9UPZ3 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
HPS5Q9UPZ3 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
HPS5Q9UPZ3 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC27.52■■■□□ 2
HPS5Q9UPZ3 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
HPS5Q9UPZ3 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
HPS5Q9UPZ3 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
HPS5Q9UPZ3 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
HPS5Q9UPZ3 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
HPS5Q9UPZ3 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
HPS5Q9UPZ3 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
HPS5Q9UPZ3 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
HPS5Q9UPZ3 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
HPS5Q9UPZ3 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
HPS5Q9UPZ3 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
HPS5Q9UPZ3 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC27.5■■□□□ 1.99
HPS5Q9UPZ3 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
HPS5Q9UPZ3 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
HPS5Q9UPZ3 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
HPS5Q9UPZ3 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
HPS5Q9UPZ3 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
HPS5Q9UPZ3 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
HPS5Q9UPZ3 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
HPS5Q9UPZ3 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
HPS5Q9UPZ3 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
HPS5Q9UPZ3 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
HPS5Q9UPZ3 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
HPS5Q9UPZ3 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
HPS5Q9UPZ3 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
HPS5Q9UPZ3 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
HPS5Q9UPZ3 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
HPS5Q9UPZ3 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
HPS5Q9UPZ3 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
HPS5Q9UPZ3 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
HPS5Q9UPZ3 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
HPS5Q9UPZ3 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
HPS5Q9UPZ3 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
HPS5Q9UPZ3 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
HPS5Q9UPZ3 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
HPS5Q9UPZ3 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
HPS5Q9UPZ3 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
HPS5Q9UPZ3 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
HPS5Q9UPZ3 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
HPS5Q9UPZ3 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
HPS5Q9UPZ3 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
HPS5Q9UPZ3 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
HPS5Q9UPZ3 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
HPS5Q9UPZ3 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
HPS5Q9UPZ3 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
HPS5Q9UPZ3 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
HPS5Q9UPZ3 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
HPS5Q9UPZ3 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
HPS5Q9UPZ3 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
HPS5Q9UPZ3 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
HPS5Q9UPZ3 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
HPS5Q9UPZ3 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
HPS5Q9UPZ3 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
HPS5Q9UPZ3 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
HPS5Q9UPZ3 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
HPS5Q9UPZ3 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
HPS5Q9UPZ3 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
HPS5Q9UPZ3 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
HPS5Q9UPZ3 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
HPS5Q9UPZ3 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
HPS5Q9UPZ3 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
HPS5Q9UPZ3 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
HPS5Q9UPZ3 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
HPS5Q9UPZ3 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
HPS5Q9UPZ3 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
HPS5Q9UPZ3 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
HPS5Q9UPZ3 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
HPS5Q9UPZ3 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
HPS5Q9UPZ3 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
HPS5Q9UPZ3 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
HPS5Q9UPZ3 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
HPS5Q9UPZ3 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
HPS5Q9UPZ3 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
HPS5Q9UPZ3 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms