Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ9

TNRC6B, Trinucleotide repeat-containing gene 6B protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNRC6BQ9UPQ9 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNRC6BQ9UPQ9 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNRC6BQ9UPQ9 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNRC6BQ9UPQ9 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNRC6BQ9UPQ9 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNRC6BQ9UPQ9 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TNRC6BQ9UPQ9 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNRC6BQ9UPQ9 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.23
TNRC6BQ9UPQ9 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNRC6BQ9UPQ9 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNRC6BQ9UPQ9 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNRC6BQ9UPQ9 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNRC6BQ9UPQ9 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNRC6BQ9UPQ9 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNRC6BQ9UPQ9 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TNRC6BQ9UPQ9 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNRC6BQ9UPQ9 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNRC6BQ9UPQ9 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TNRC6BQ9UPQ9 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNRC6BQ9UPQ9 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TNRC6BQ9UPQ9 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TNRC6BQ9UPQ9 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNRC6BQ9UPQ9 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNRC6BQ9UPQ9 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNRC6BQ9UPQ9 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNRC6BQ9UPQ9 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNRC6BQ9UPQ9 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNRC6BQ9UPQ9 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNRC6BQ9UPQ9 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TNRC6BQ9UPQ9 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNRC6BQ9UPQ9 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNRC6BQ9UPQ9 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNRC6BQ9UPQ9 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNRC6BQ9UPQ9 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNRC6BQ9UPQ9 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNRC6BQ9UPQ9 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNRC6BQ9UPQ9 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNRC6BQ9UPQ9 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNRC6BQ9UPQ9 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNRC6BQ9UPQ9 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNRC6BQ9UPQ9 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNRC6BQ9UPQ9 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNRC6BQ9UPQ9 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNRC6BQ9UPQ9 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNRC6BQ9UPQ9 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNRC6BQ9UPQ9 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNRC6BQ9UPQ9 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNRC6BQ9UPQ9 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNRC6BQ9UPQ9 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNRC6BQ9UPQ9 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNRC6BQ9UPQ9 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNRC6BQ9UPQ9 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNRC6BQ9UPQ9 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNRC6BQ9UPQ9 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TNRC6BQ9UPQ9 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNRC6BQ9UPQ9 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNRC6BQ9UPQ9 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNRC6BQ9UPQ9 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNRC6BQ9UPQ9 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNRC6BQ9UPQ9 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNRC6BQ9UPQ9 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNRC6BQ9UPQ9 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNRC6BQ9UPQ9 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNRC6BQ9UPQ9 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNRC6BQ9UPQ9 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TNRC6BQ9UPQ9 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNRC6BQ9UPQ9 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNRC6BQ9UPQ9 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNRC6BQ9UPQ9 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNRC6BQ9UPQ9 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNRC6BQ9UPQ9 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TNRC6BQ9UPQ9 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TNRC6BQ9UPQ9 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TNRC6BQ9UPQ9 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TNRC6BQ9UPQ9 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNRC6BQ9UPQ9 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNRC6BQ9UPQ9 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNRC6BQ9UPQ9 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNRC6BQ9UPQ9 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNRC6BQ9UPQ9 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNRC6BQ9UPQ9 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNRC6BQ9UPQ9 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNRC6BQ9UPQ9 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNRC6BQ9UPQ9 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNRC6BQ9UPQ9 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TNRC6BQ9UPQ9 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TNRC6BQ9UPQ9 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNRC6BQ9UPQ9 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNRC6BQ9UPQ9 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNRC6BQ9UPQ9 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNRC6BQ9UPQ9 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNRC6BQ9UPQ9 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNRC6BQ9UPQ9 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNRC6BQ9UPQ9 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TNRC6BQ9UPQ9 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNRC6BQ9UPQ9 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNRC6BQ9UPQ9 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNRC6BQ9UPQ9 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TNRC6BQ9UPQ9 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TNRC6BQ9UPQ9 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms