Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNG2

TNFSF18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF18Q9UNG2 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TNFSF18Q9UNG2 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TNFSF18Q9UNG2 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TNFSF18Q9UNG2 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TNFSF18Q9UNG2 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TNFSF18Q9UNG2 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TNFSF18Q9UNG2 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TNFSF18Q9UNG2 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TNFSF18Q9UNG2 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TNFSF18Q9UNG2 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TNFSF18Q9UNG2 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TNFSF18Q9UNG2 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TNFSF18Q9UNG2 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TNFSF18Q9UNG2 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TNFSF18Q9UNG2 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TNFSF18Q9UNG2 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TNFSF18Q9UNG2 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TNFSF18Q9UNG2 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TNFSF18Q9UNG2 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TNFSF18Q9UNG2 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
TNFSF18Q9UNG2 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
TNFSF18Q9UNG2 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
TNFSF18Q9UNG2 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
TNFSF18Q9UNG2 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TNFSF18Q9UNG2 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TNFSF18Q9UNG2 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TNFSF18Q9UNG2 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TNFSF18Q9UNG2 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TNFSF18Q9UNG2 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TNFSF18Q9UNG2 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
TNFSF18Q9UNG2 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TNFSF18Q9UNG2 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TNFSF18Q9UNG2 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TNFSF18Q9UNG2 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TNFSF18Q9UNG2 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TNFSF18Q9UNG2 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TNFSF18Q9UNG2 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TNFSF18Q9UNG2 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TNFSF18Q9UNG2 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TNFSF18Q9UNG2 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TNFSF18Q9UNG2 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TNFSF18Q9UNG2 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TNFSF18Q9UNG2 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TNFSF18Q9UNG2 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TNFSF18Q9UNG2 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TNFSF18Q9UNG2 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TNFSF18Q9UNG2 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TNFSF18Q9UNG2 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TNFSF18Q9UNG2 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
TNFSF18Q9UNG2 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TNFSF18Q9UNG2 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TNFSF18Q9UNG2 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TNFSF18Q9UNG2 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TNFSF18Q9UNG2 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TNFSF18Q9UNG2 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TNFSF18Q9UNG2 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TNFSF18Q9UNG2 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TNFSF18Q9UNG2 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TNFSF18Q9UNG2 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TNFSF18Q9UNG2 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TNFSF18Q9UNG2 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TNFSF18Q9UNG2 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TNFSF18Q9UNG2 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TNFSF18Q9UNG2 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TNFSF18Q9UNG2 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TNFSF18Q9UNG2 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TNFSF18Q9UNG2 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TNFSF18Q9UNG2 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TNFSF18Q9UNG2 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TNFSF18Q9UNG2 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TNFSF18Q9UNG2 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TNFSF18Q9UNG2 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TNFSF18Q9UNG2 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TNFSF18Q9UNG2 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TNFSF18Q9UNG2 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TNFSF18Q9UNG2 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TNFSF18Q9UNG2 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TNFSF18Q9UNG2 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TNFSF18Q9UNG2 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TNFSF18Q9UNG2 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TNFSF18Q9UNG2 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TNFSF18Q9UNG2 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TNFSF18Q9UNG2 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TNFSF18Q9UNG2 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TNFSF18Q9UNG2 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TNFSF18Q9UNG2 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
TNFSF18Q9UNG2 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TNFSF18Q9UNG2 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
TNFSF18Q9UNG2 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
TNFSF18Q9UNG2 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
TNFSF18Q9UNG2 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
TNFSF18Q9UNG2 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TNFSF18Q9UNG2 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TNFSF18Q9UNG2 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TNFSF18Q9UNG2 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TNFSF18Q9UNG2 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
TNFSF18Q9UNG2 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TNFSF18Q9UNG2 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TNFSF18Q9UNG2 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TNFSF18Q9UNG2 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms