Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULC6

PADI1, Protein-arginine deiminase type-1, humanhuman

Predictions only

Length 663 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PADI1Q9ULC6 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PADI1Q9ULC6 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PADI1Q9ULC6 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
PADI1Q9ULC6 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PADI1Q9ULC6 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PADI1Q9ULC6 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PADI1Q9ULC6 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PADI1Q9ULC6 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PADI1Q9ULC6 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PADI1Q9ULC6 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PADI1Q9ULC6 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PADI1Q9ULC6 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PADI1Q9ULC6 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PADI1Q9ULC6 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PADI1Q9ULC6 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PADI1Q9ULC6 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PADI1Q9ULC6 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PADI1Q9ULC6 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PADI1Q9ULC6 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PADI1Q9ULC6 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
PADI1Q9ULC6 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PADI1Q9ULC6 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
PADI1Q9ULC6 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PADI1Q9ULC6 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PADI1Q9ULC6 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PADI1Q9ULC6 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PADI1Q9ULC6 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
PADI1Q9ULC6 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PADI1Q9ULC6 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PADI1Q9ULC6 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PADI1Q9ULC6 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PADI1Q9ULC6 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PADI1Q9ULC6 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PADI1Q9ULC6 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PADI1Q9ULC6 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PADI1Q9ULC6 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PADI1Q9ULC6 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
PADI1Q9ULC6 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PADI1Q9ULC6 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PADI1Q9ULC6 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PADI1Q9ULC6 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
PADI1Q9ULC6 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PADI1Q9ULC6 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PADI1Q9ULC6 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PADI1Q9ULC6 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PADI1Q9ULC6 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PADI1Q9ULC6 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PADI1Q9ULC6 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PADI1Q9ULC6 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PADI1Q9ULC6 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PADI1Q9ULC6 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PADI1Q9ULC6 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PADI1Q9ULC6 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PADI1Q9ULC6 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PADI1Q9ULC6 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PADI1Q9ULC6 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PADI1Q9ULC6 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PADI1Q9ULC6 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PADI1Q9ULC6 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PADI1Q9ULC6 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PADI1Q9ULC6 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PADI1Q9ULC6 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PADI1Q9ULC6 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PADI1Q9ULC6 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PADI1Q9ULC6 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PADI1Q9ULC6 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PADI1Q9ULC6 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PADI1Q9ULC6 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PADI1Q9ULC6 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PADI1Q9ULC6 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PADI1Q9ULC6 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PADI1Q9ULC6 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PADI1Q9ULC6 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PADI1Q9ULC6 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PADI1Q9ULC6 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PADI1Q9ULC6 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PADI1Q9ULC6 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PADI1Q9ULC6 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PADI1Q9ULC6 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PADI1Q9ULC6 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PADI1Q9ULC6 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PADI1Q9ULC6 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PADI1Q9ULC6 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PADI1Q9ULC6 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PADI1Q9ULC6 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PADI1Q9ULC6 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PADI1Q9ULC6 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PADI1Q9ULC6 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PADI1Q9ULC6 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PADI1Q9ULC6 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PADI1Q9ULC6 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PADI1Q9ULC6 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PADI1Q9ULC6 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PADI1Q9ULC6 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PADI1Q9ULC6 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PADI1Q9ULC6 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PADI1Q9ULC6 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PADI1Q9ULC6 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PADI1Q9ULC6 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PADI1Q9ULC6 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.8 ms