Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL12

SARDH, Sarcosine dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 918 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SARDHQ9UL12 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SARDHQ9UL12 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SARDHQ9UL12 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SARDHQ9UL12 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SARDHQ9UL12 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SARDHQ9UL12 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SARDHQ9UL12 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SARDHQ9UL12 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SARDHQ9UL12 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SARDHQ9UL12 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SARDHQ9UL12 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SARDHQ9UL12 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SARDHQ9UL12 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SARDHQ9UL12 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SARDHQ9UL12 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SARDHQ9UL12 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SARDHQ9UL12 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SARDHQ9UL12 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SARDHQ9UL12 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SARDHQ9UL12 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SARDHQ9UL12 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SARDHQ9UL12 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SARDHQ9UL12 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SARDHQ9UL12 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SARDHQ9UL12 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SARDHQ9UL12 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SARDHQ9UL12 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SARDHQ9UL12 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SARDHQ9UL12 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SARDHQ9UL12 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SARDHQ9UL12 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SARDHQ9UL12 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SARDHQ9UL12 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SARDHQ9UL12 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SARDHQ9UL12 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SARDHQ9UL12 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SARDHQ9UL12 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SARDHQ9UL12 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SARDHQ9UL12 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SARDHQ9UL12 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SARDHQ9UL12 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SARDHQ9UL12 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SARDHQ9UL12 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SARDHQ9UL12 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SARDHQ9UL12 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SARDHQ9UL12 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SARDHQ9UL12 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SARDHQ9UL12 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SARDHQ9UL12 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SARDHQ9UL12 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SARDHQ9UL12 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SARDHQ9UL12 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SARDHQ9UL12 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SARDHQ9UL12 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SARDHQ9UL12 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SARDHQ9UL12 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SARDHQ9UL12 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SARDHQ9UL12 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SARDHQ9UL12 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SARDHQ9UL12 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SARDHQ9UL12 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SARDHQ9UL12 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SARDHQ9UL12 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SARDHQ9UL12 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SARDHQ9UL12 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SARDHQ9UL12 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SARDHQ9UL12 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SARDHQ9UL12 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SARDHQ9UL12 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SARDHQ9UL12 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SARDHQ9UL12 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SARDHQ9UL12 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SARDHQ9UL12 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SARDHQ9UL12 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SARDHQ9UL12 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SARDHQ9UL12 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SARDHQ9UL12 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SARDHQ9UL12 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SARDHQ9UL12 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SARDHQ9UL12 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SARDHQ9UL12 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SARDHQ9UL12 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SARDHQ9UL12 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SARDHQ9UL12 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SARDHQ9UL12 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SARDHQ9UL12 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SARDHQ9UL12 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SARDHQ9UL12 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SARDHQ9UL12 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SARDHQ9UL12 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SARDHQ9UL12 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SARDHQ9UL12 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SARDHQ9UL12 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SARDHQ9UL12 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SARDHQ9UL12 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SARDHQ9UL12 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SARDHQ9UL12 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SARDHQ9UL12 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SARDHQ9UL12 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SARDHQ9UL12 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 160 ms