Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKT5

FBXO4, F-box only protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO4Q9UKT5 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FBXO4Q9UKT5 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FBXO4Q9UKT5 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FBXO4Q9UKT5 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FBXO4Q9UKT5 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FBXO4Q9UKT5 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FBXO4Q9UKT5 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FBXO4Q9UKT5 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FBXO4Q9UKT5 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FBXO4Q9UKT5 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FBXO4Q9UKT5 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FBXO4Q9UKT5 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FBXO4Q9UKT5 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
FBXO4Q9UKT5 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
FBXO4Q9UKT5 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
FBXO4Q9UKT5 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
FBXO4Q9UKT5 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FBXO4Q9UKT5 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
FBXO4Q9UKT5 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FBXO4Q9UKT5 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FBXO4Q9UKT5 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
FBXO4Q9UKT5 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FBXO4Q9UKT5 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FBXO4Q9UKT5 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FBXO4Q9UKT5 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FBXO4Q9UKT5 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
FBXO4Q9UKT5 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FBXO4Q9UKT5 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FBXO4Q9UKT5 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
FBXO4Q9UKT5 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
FBXO4Q9UKT5 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
FBXO4Q9UKT5 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
FBXO4Q9UKT5 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
FBXO4Q9UKT5 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
FBXO4Q9UKT5 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FBXO4Q9UKT5 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FBXO4Q9UKT5 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FBXO4Q9UKT5 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FBXO4Q9UKT5 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FBXO4Q9UKT5 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FBXO4Q9UKT5 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
FBXO4Q9UKT5 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FBXO4Q9UKT5 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FBXO4Q9UKT5 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
FBXO4Q9UKT5 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FBXO4Q9UKT5 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FBXO4Q9UKT5 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FBXO4Q9UKT5 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FBXO4Q9UKT5 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
FBXO4Q9UKT5 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FBXO4Q9UKT5 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FBXO4Q9UKT5 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FBXO4Q9UKT5 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FBXO4Q9UKT5 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
FBXO4Q9UKT5 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FBXO4Q9UKT5 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FBXO4Q9UKT5 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FBXO4Q9UKT5 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FBXO4Q9UKT5 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FBXO4Q9UKT5 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FBXO4Q9UKT5 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FBXO4Q9UKT5 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FBXO4Q9UKT5 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FBXO4Q9UKT5 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FBXO4Q9UKT5 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FBXO4Q9UKT5 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FBXO4Q9UKT5 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FBXO4Q9UKT5 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FBXO4Q9UKT5 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FBXO4Q9UKT5 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FBXO4Q9UKT5 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
FBXO4Q9UKT5 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FBXO4Q9UKT5 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FBXO4Q9UKT5 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FBXO4Q9UKT5 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FBXO4Q9UKT5 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FBXO4Q9UKT5 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
FBXO4Q9UKT5 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FBXO4Q9UKT5 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
FBXO4Q9UKT5 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FBXO4Q9UKT5 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FBXO4Q9UKT5 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FBXO4Q9UKT5 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FBXO4Q9UKT5 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FBXO4Q9UKT5 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FBXO4Q9UKT5 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FBXO4Q9UKT5 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FBXO4Q9UKT5 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FBXO4Q9UKT5 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FBXO4Q9UKT5 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FBXO4Q9UKT5 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FBXO4Q9UKT5 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FBXO4Q9UKT5 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
FBXO4Q9UKT5 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FBXO4Q9UKT5 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FBXO4Q9UKT5 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FBXO4Q9UKT5 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FBXO4Q9UKT5 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FBXO4Q9UKT5 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FBXO4Q9UKT5 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms