Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKJ5

CHIC2, Cysteine-rich hydrophobic domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHIC2Q9UKJ5 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
CHIC2Q9UKJ5 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
CHIC2Q9UKJ5 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
CHIC2Q9UKJ5 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
CHIC2Q9UKJ5 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.72■■■■□ 3.15
CHIC2Q9UKJ5 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC34.72■■■■□ 3.15
CHIC2Q9UKJ5 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
CHIC2Q9UKJ5 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
CHIC2Q9UKJ5 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
CHIC2Q9UKJ5 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC34.71■■■■□ 3.15
CHIC2Q9UKJ5 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC34.7■■■■□ 3.15
CHIC2Q9UKJ5 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC34.7■■■■□ 3.15
CHIC2Q9UKJ5 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
CHIC2Q9UKJ5 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC34.7■■■■□ 3.14
CHIC2Q9UKJ5 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC34.69■■■■□ 3.14
CHIC2Q9UKJ5 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC34.69■■■■□ 3.14
CHIC2Q9UKJ5 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.69■■■■□ 3.14
CHIC2Q9UKJ5 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
CHIC2Q9UKJ5 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.69■■■■□ 3.14
CHIC2Q9UKJ5 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
CHIC2Q9UKJ5 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
CHIC2Q9UKJ5 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
CHIC2Q9UKJ5 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
CHIC2Q9UKJ5 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
CHIC2Q9UKJ5 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
CHIC2Q9UKJ5 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.68■■■■□ 3.14
CHIC2Q9UKJ5 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC34.68■■■■□ 3.14
CHIC2Q9UKJ5 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
CHIC2Q9UKJ5 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC34.67■■■■□ 3.14
CHIC2Q9UKJ5 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC34.67■■■■□ 3.14
CHIC2Q9UKJ5 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
CHIC2Q9UKJ5 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
CHIC2Q9UKJ5 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
CHIC2Q9UKJ5 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.66■■■■□ 3.14
CHIC2Q9UKJ5 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
CHIC2Q9UKJ5 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
CHIC2Q9UKJ5 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC34.66■■■■□ 3.14
CHIC2Q9UKJ5 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
CHIC2Q9UKJ5 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
CHIC2Q9UKJ5 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
CHIC2Q9UKJ5 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC34.65■■■■□ 3.14
CHIC2Q9UKJ5 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC34.65■■■■□ 3.14
CHIC2Q9UKJ5 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
CHIC2Q9UKJ5 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC34.64■■■■□ 3.14
CHIC2Q9UKJ5 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC34.64■■■■□ 3.14
CHIC2Q9UKJ5 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
CHIC2Q9UKJ5 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC34.64■■■■□ 3.14
CHIC2Q9UKJ5 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC34.64■■■■□ 3.14
CHIC2Q9UKJ5 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
CHIC2Q9UKJ5 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
CHIC2Q9UKJ5 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC34.64■■■■□ 3.14
CHIC2Q9UKJ5 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.64■■■■□ 3.14
CHIC2Q9UKJ5 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
CHIC2Q9UKJ5 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC34.64■■■■□ 3.14
CHIC2Q9UKJ5 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC34.63■■■■□ 3.13
CHIC2Q9UKJ5 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC34.63■■■■□ 3.13
CHIC2Q9UKJ5 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
CHIC2Q9UKJ5 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC34.63■■■■□ 3.13
CHIC2Q9UKJ5 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC34.63■■■■□ 3.13
CHIC2Q9UKJ5 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
CHIC2Q9UKJ5 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC34.63■■■■□ 3.13
CHIC2Q9UKJ5 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
CHIC2Q9UKJ5 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
CHIC2Q9UKJ5 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
CHIC2Q9UKJ5 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
CHIC2Q9UKJ5 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
CHIC2Q9UKJ5 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC34.62■■■■□ 3.13
CHIC2Q9UKJ5 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.62■■■■□ 3.13
CHIC2Q9UKJ5 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC34.62■■■■□ 3.13
CHIC2Q9UKJ5 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC34.62■■■■□ 3.13
CHIC2Q9UKJ5 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
CHIC2Q9UKJ5 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
CHIC2Q9UKJ5 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
CHIC2Q9UKJ5 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
CHIC2Q9UKJ5 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
CHIC2Q9UKJ5 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
CHIC2Q9UKJ5 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.6■■■■□ 3.13
CHIC2Q9UKJ5 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
CHIC2Q9UKJ5 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
CHIC2Q9UKJ5 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
CHIC2Q9UKJ5 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
CHIC2Q9UKJ5 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
CHIC2Q9UKJ5 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
CHIC2Q9UKJ5 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC34.6■■■■□ 3.13
CHIC2Q9UKJ5 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC34.6■■■■□ 3.13
CHIC2Q9UKJ5 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.6■■■■□ 3.13
CHIC2Q9UKJ5 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC34.59■■■■□ 3.13
CHIC2Q9UKJ5 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
CHIC2Q9UKJ5 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
CHIC2Q9UKJ5 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
CHIC2Q9UKJ5 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC34.59■■■■□ 3.13
CHIC2Q9UKJ5 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC34.59■■■■□ 3.13
CHIC2Q9UKJ5 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
CHIC2Q9UKJ5 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
CHIC2Q9UKJ5 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC34.58■■■■□ 3.13
CHIC2Q9UKJ5 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC34.58■■■■□ 3.13
CHIC2Q9UKJ5 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
CHIC2Q9UKJ5 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC34.58■■■■□ 3.13
CHIC2Q9UKJ5 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC34.58■■■■□ 3.13
CHIC2Q9UKJ5 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.1 ms