Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK00

C3orf18, Uncharacterized protein C3orf18, humanhuman

Predictions only

Length 162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C3orf18Q9UK00 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C3orf18Q9UK00 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
C3orf18Q9UK00 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C3orf18Q9UK00 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C3orf18Q9UK00 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C3orf18Q9UK00 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C3orf18Q9UK00 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C3orf18Q9UK00 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C3orf18Q9UK00 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C3orf18Q9UK00 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C3orf18Q9UK00 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C3orf18Q9UK00 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C3orf18Q9UK00 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
C3orf18Q9UK00 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
C3orf18Q9UK00 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C3orf18Q9UK00 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C3orf18Q9UK00 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C3orf18Q9UK00 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C3orf18Q9UK00 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C3orf18Q9UK00 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C3orf18Q9UK00 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C3orf18Q9UK00 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C3orf18Q9UK00 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C3orf18Q9UK00 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C3orf18Q9UK00 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C3orf18Q9UK00 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C3orf18Q9UK00 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C3orf18Q9UK00 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C3orf18Q9UK00 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C3orf18Q9UK00 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C3orf18Q9UK00 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C3orf18Q9UK00 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C3orf18Q9UK00 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C3orf18Q9UK00 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C3orf18Q9UK00 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C3orf18Q9UK00 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C3orf18Q9UK00 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C3orf18Q9UK00 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
C3orf18Q9UK00 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C3orf18Q9UK00 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C3orf18Q9UK00 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C3orf18Q9UK00 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
C3orf18Q9UK00 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
C3orf18Q9UK00 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
C3orf18Q9UK00 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
C3orf18Q9UK00 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
C3orf18Q9UK00 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
C3orf18Q9UK00 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
C3orf18Q9UK00 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
C3orf18Q9UK00 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
C3orf18Q9UK00 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
C3orf18Q9UK00 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
C3orf18Q9UK00 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
C3orf18Q9UK00 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
C3orf18Q9UK00 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
C3orf18Q9UK00 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C3orf18Q9UK00 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C3orf18Q9UK00 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C3orf18Q9UK00 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
C3orf18Q9UK00 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C3orf18Q9UK00 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C3orf18Q9UK00 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
C3orf18Q9UK00 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
C3orf18Q9UK00 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C3orf18Q9UK00 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C3orf18Q9UK00 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C3orf18Q9UK00 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
C3orf18Q9UK00 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C3orf18Q9UK00 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C3orf18Q9UK00 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C3orf18Q9UK00 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C3orf18Q9UK00 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C3orf18Q9UK00 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C3orf18Q9UK00 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
C3orf18Q9UK00 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C3orf18Q9UK00 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C3orf18Q9UK00 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
C3orf18Q9UK00 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C3orf18Q9UK00 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
C3orf18Q9UK00 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
C3orf18Q9UK00 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C3orf18Q9UK00 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
C3orf18Q9UK00 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
C3orf18Q9UK00 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
C3orf18Q9UK00 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C3orf18Q9UK00 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C3orf18Q9UK00 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C3orf18Q9UK00 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
C3orf18Q9UK00 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C3orf18Q9UK00 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C3orf18Q9UK00 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C3orf18Q9UK00 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
C3orf18Q9UK00 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
C3orf18Q9UK00 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C3orf18Q9UK00 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
C3orf18Q9UK00 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
C3orf18Q9UK00 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C3orf18Q9UK00 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C3orf18Q9UK00 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C3orf18Q9UK00 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms