Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJA2

CRLS1, Cardiolipin synthase (CMP-forming), humanhuman

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRLS1Q9UJA2 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CRLS1Q9UJA2 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CRLS1Q9UJA2 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CRLS1Q9UJA2 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CRLS1Q9UJA2 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CRLS1Q9UJA2 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CRLS1Q9UJA2 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CRLS1Q9UJA2 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CRLS1Q9UJA2 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CRLS1Q9UJA2 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CRLS1Q9UJA2 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CRLS1Q9UJA2 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CRLS1Q9UJA2 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CRLS1Q9UJA2 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CRLS1Q9UJA2 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CRLS1Q9UJA2 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CRLS1Q9UJA2 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CRLS1Q9UJA2 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CRLS1Q9UJA2 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CRLS1Q9UJA2 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CRLS1Q9UJA2 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CRLS1Q9UJA2 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CRLS1Q9UJA2 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CRLS1Q9UJA2 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CRLS1Q9UJA2 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CRLS1Q9UJA2 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CRLS1Q9UJA2 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CRLS1Q9UJA2 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CRLS1Q9UJA2 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CRLS1Q9UJA2 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CRLS1Q9UJA2 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CRLS1Q9UJA2 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CRLS1Q9UJA2 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CRLS1Q9UJA2 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CRLS1Q9UJA2 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CRLS1Q9UJA2 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CRLS1Q9UJA2 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CRLS1Q9UJA2 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CRLS1Q9UJA2 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CRLS1Q9UJA2 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CRLS1Q9UJA2 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CRLS1Q9UJA2 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CRLS1Q9UJA2 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CRLS1Q9UJA2 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CRLS1Q9UJA2 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CRLS1Q9UJA2 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CRLS1Q9UJA2 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CRLS1Q9UJA2 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CRLS1Q9UJA2 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CRLS1Q9UJA2 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CRLS1Q9UJA2 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CRLS1Q9UJA2 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CRLS1Q9UJA2 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CRLS1Q9UJA2 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CRLS1Q9UJA2 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CRLS1Q9UJA2 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CRLS1Q9UJA2 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CRLS1Q9UJA2 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CRLS1Q9UJA2 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CRLS1Q9UJA2 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CRLS1Q9UJA2 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CRLS1Q9UJA2 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CRLS1Q9UJA2 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CRLS1Q9UJA2 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CRLS1Q9UJA2 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CRLS1Q9UJA2 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CRLS1Q9UJA2 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CRLS1Q9UJA2 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CRLS1Q9UJA2 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CRLS1Q9UJA2 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CRLS1Q9UJA2 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CRLS1Q9UJA2 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CRLS1Q9UJA2 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CRLS1Q9UJA2 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CRLS1Q9UJA2 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CRLS1Q9UJA2 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CRLS1Q9UJA2 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CRLS1Q9UJA2 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CRLS1Q9UJA2 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CRLS1Q9UJA2 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CRLS1Q9UJA2 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CRLS1Q9UJA2 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CRLS1Q9UJA2 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CRLS1Q9UJA2 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CRLS1Q9UJA2 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CRLS1Q9UJA2 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CRLS1Q9UJA2 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CRLS1Q9UJA2 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CRLS1Q9UJA2 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CRLS1Q9UJA2 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CRLS1Q9UJA2 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CRLS1Q9UJA2 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CRLS1Q9UJA2 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CRLS1Q9UJA2 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CRLS1Q9UJA2 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CRLS1Q9UJA2 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CRLS1Q9UJA2 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CRLS1Q9UJA2 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CRLS1Q9UJA2 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CRLS1Q9UJA2 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms