Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIG8

SLCO3A1, Solute carrier organic anion transporter family member 3A1, humanhuman

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLCO3A1Q9UIG8 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLCO3A1Q9UIG8 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLCO3A1Q9UIG8 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLCO3A1Q9UIG8 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLCO3A1Q9UIG8 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLCO3A1Q9UIG8 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLCO3A1Q9UIG8 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLCO3A1Q9UIG8 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SLCO3A1Q9UIG8 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLCO3A1Q9UIG8 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLCO3A1Q9UIG8 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLCO3A1Q9UIG8 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLCO3A1Q9UIG8 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLCO3A1Q9UIG8 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLCO3A1Q9UIG8 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLCO3A1Q9UIG8 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLCO3A1Q9UIG8 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLCO3A1Q9UIG8 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLCO3A1Q9UIG8 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLCO3A1Q9UIG8 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLCO3A1Q9UIG8 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLCO3A1Q9UIG8 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLCO3A1Q9UIG8 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLCO3A1Q9UIG8 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLCO3A1Q9UIG8 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLCO3A1Q9UIG8 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLCO3A1Q9UIG8 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLCO3A1Q9UIG8 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLCO3A1Q9UIG8 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLCO3A1Q9UIG8 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLCO3A1Q9UIG8 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLCO3A1Q9UIG8 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SLCO3A1Q9UIG8 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SLCO3A1Q9UIG8 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLCO3A1Q9UIG8 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLCO3A1Q9UIG8 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLCO3A1Q9UIG8 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SLCO3A1Q9UIG8 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SLCO3A1Q9UIG8 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLCO3A1Q9UIG8 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLCO3A1Q9UIG8 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLCO3A1Q9UIG8 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLCO3A1Q9UIG8 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLCO3A1Q9UIG8 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLCO3A1Q9UIG8 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLCO3A1Q9UIG8 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLCO3A1Q9UIG8 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLCO3A1Q9UIG8 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLCO3A1Q9UIG8 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLCO3A1Q9UIG8 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SLCO3A1Q9UIG8 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLCO3A1Q9UIG8 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLCO3A1Q9UIG8 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLCO3A1Q9UIG8 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLCO3A1Q9UIG8 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLCO3A1Q9UIG8 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLCO3A1Q9UIG8 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SLCO3A1Q9UIG8 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLCO3A1Q9UIG8 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLCO3A1Q9UIG8 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLCO3A1Q9UIG8 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLCO3A1Q9UIG8 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLCO3A1Q9UIG8 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLCO3A1Q9UIG8 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLCO3A1Q9UIG8 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLCO3A1Q9UIG8 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLCO3A1Q9UIG8 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLCO3A1Q9UIG8 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLCO3A1Q9UIG8 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLCO3A1Q9UIG8 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLCO3A1Q9UIG8 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLCO3A1Q9UIG8 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLCO3A1Q9UIG8 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLCO3A1Q9UIG8 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLCO3A1Q9UIG8 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLCO3A1Q9UIG8 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLCO3A1Q9UIG8 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLCO3A1Q9UIG8 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLCO3A1Q9UIG8 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLCO3A1Q9UIG8 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLCO3A1Q9UIG8 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SLCO3A1Q9UIG8 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLCO3A1Q9UIG8 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLCO3A1Q9UIG8 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLCO3A1Q9UIG8 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLCO3A1Q9UIG8 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLCO3A1Q9UIG8 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLCO3A1Q9UIG8 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLCO3A1Q9UIG8 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLCO3A1Q9UIG8 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLCO3A1Q9UIG8 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLCO3A1Q9UIG8 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLCO3A1Q9UIG8 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLCO3A1Q9UIG8 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLCO3A1Q9UIG8 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLCO3A1Q9UIG8 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SLCO3A1Q9UIG8 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLCO3A1Q9UIG8 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLCO3A1Q9UIG8 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLCO3A1Q9UIG8 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms