Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI40

SLC24A2, Sodium/potassium/calcium exchanger 2, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC24A2Q9UI40 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC24A2Q9UI40 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC24A2Q9UI40 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC24A2Q9UI40 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC24A2Q9UI40 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC24A2Q9UI40 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC24A2Q9UI40 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SLC24A2Q9UI40 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SLC24A2Q9UI40 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SLC24A2Q9UI40 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC24A2Q9UI40 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC24A2Q9UI40 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC24A2Q9UI40 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC24A2Q9UI40 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC24A2Q9UI40 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC24A2Q9UI40 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC24A2Q9UI40 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC24A2Q9UI40 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC24A2Q9UI40 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC24A2Q9UI40 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC24A2Q9UI40 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC24A2Q9UI40 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC24A2Q9UI40 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC24A2Q9UI40 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC24A2Q9UI40 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC24A2Q9UI40 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC24A2Q9UI40 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC24A2Q9UI40 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC24A2Q9UI40 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC24A2Q9UI40 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC24A2Q9UI40 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC24A2Q9UI40 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC24A2Q9UI40 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC24A2Q9UI40 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC24A2Q9UI40 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC24A2Q9UI40 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC24A2Q9UI40 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC24A2Q9UI40 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC24A2Q9UI40 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC24A2Q9UI40 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC24A2Q9UI40 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC24A2Q9UI40 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC24A2Q9UI40 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC24A2Q9UI40 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC24A2Q9UI40 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC24A2Q9UI40 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC24A2Q9UI40 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC24A2Q9UI40 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC24A2Q9UI40 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC24A2Q9UI40 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC24A2Q9UI40 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC24A2Q9UI40 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC24A2Q9UI40 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC24A2Q9UI40 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC24A2Q9UI40 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC24A2Q9UI40 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC24A2Q9UI40 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC24A2Q9UI40 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC24A2Q9UI40 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC24A2Q9UI40 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC24A2Q9UI40 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC24A2Q9UI40 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC24A2Q9UI40 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SLC24A2Q9UI40 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC24A2Q9UI40 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC24A2Q9UI40 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC24A2Q9UI40 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC24A2Q9UI40 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC24A2Q9UI40 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC24A2Q9UI40 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC24A2Q9UI40 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC24A2Q9UI40 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC24A2Q9UI40 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC24A2Q9UI40 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC24A2Q9UI40 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC24A2Q9UI40 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC24A2Q9UI40 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC24A2Q9UI40 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC24A2Q9UI40 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC24A2Q9UI40 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC24A2Q9UI40 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC24A2Q9UI40 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC24A2Q9UI40 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC24A2Q9UI40 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC24A2Q9UI40 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC24A2Q9UI40 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC24A2Q9UI40 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC24A2Q9UI40 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC24A2Q9UI40 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC24A2Q9UI40 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC24A2Q9UI40 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC24A2Q9UI40 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC24A2Q9UI40 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC24A2Q9UI40 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC24A2Q9UI40 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC24A2Q9UI40 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC24A2Q9UI40 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC24A2Q9UI40 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC24A2Q9UI40 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC24A2Q9UI40 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms