Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHB9

SRP68, Signal recognition particle subunit SRP68, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRP68Q9UHB9 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SRP68Q9UHB9 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
SRP68Q9UHB9 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
SRP68Q9UHB9 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
SRP68Q9UHB9 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
SRP68Q9UHB9 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
SRP68Q9UHB9 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
SRP68Q9UHB9 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SRP68Q9UHB9 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SRP68Q9UHB9 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SRP68Q9UHB9 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SRP68Q9UHB9 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SRP68Q9UHB9 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
SRP68Q9UHB9 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
SRP68Q9UHB9 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
SRP68Q9UHB9 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
SRP68Q9UHB9 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
SRP68Q9UHB9 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
SRP68Q9UHB9 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SRP68Q9UHB9 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SRP68Q9UHB9 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SRP68Q9UHB9 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SRP68Q9UHB9 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SRP68Q9UHB9 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SRP68Q9UHB9 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SRP68Q9UHB9 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SRP68Q9UHB9 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SRP68Q9UHB9 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SRP68Q9UHB9 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SRP68Q9UHB9 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
SRP68Q9UHB9 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
SRP68Q9UHB9 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
SRP68Q9UHB9 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
SRP68Q9UHB9 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
SRP68Q9UHB9 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
SRP68Q9UHB9 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
SRP68Q9UHB9 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
SRP68Q9UHB9 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
SRP68Q9UHB9 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
SRP68Q9UHB9 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SRP68Q9UHB9 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
SRP68Q9UHB9 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
SRP68Q9UHB9 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
SRP68Q9UHB9 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SRP68Q9UHB9 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
SRP68Q9UHB9 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
SRP68Q9UHB9 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
SRP68Q9UHB9 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SRP68Q9UHB9 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
SRP68Q9UHB9 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
SRP68Q9UHB9 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SRP68Q9UHB9 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SRP68Q9UHB9 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SRP68Q9UHB9 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SRP68Q9UHB9 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SRP68Q9UHB9 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SRP68Q9UHB9 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SRP68Q9UHB9 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SRP68Q9UHB9 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SRP68Q9UHB9 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SRP68Q9UHB9 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
SRP68Q9UHB9 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SRP68Q9UHB9 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SRP68Q9UHB9 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SRP68Q9UHB9 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SRP68Q9UHB9 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SRP68Q9UHB9 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SRP68Q9UHB9 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SRP68Q9UHB9 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SRP68Q9UHB9 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
SRP68Q9UHB9 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC29.14■■■□□ 2.25
SRP68Q9UHB9 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SRP68Q9UHB9 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SRP68Q9UHB9 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SRP68Q9UHB9 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SRP68Q9UHB9 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SRP68Q9UHB9 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SRP68Q9UHB9 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
SRP68Q9UHB9 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
SRP68Q9UHB9 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SRP68Q9UHB9 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SRP68Q9UHB9 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SRP68Q9UHB9 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SRP68Q9UHB9 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SRP68Q9UHB9 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SRP68Q9UHB9 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SRP68Q9UHB9 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SRP68Q9UHB9 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SRP68Q9UHB9 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SRP68Q9UHB9 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SRP68Q9UHB9 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SRP68Q9UHB9 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SRP68Q9UHB9 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SRP68Q9UHB9 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SRP68Q9UHB9 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SRP68Q9UHB9 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SRP68Q9UHB9 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SRP68Q9UHB9 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SRP68Q9UHB9 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SRP68Q9UHB9 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms