Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGU0

TCF20, Transcription factor 20, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF20Q9UGU0 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TCF20Q9UGU0 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TCF20Q9UGU0 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TCF20Q9UGU0 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TCF20Q9UGU0 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TCF20Q9UGU0 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
TCF20Q9UGU0 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TCF20Q9UGU0 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TCF20Q9UGU0 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TCF20Q9UGU0 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TCF20Q9UGU0 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TCF20Q9UGU0 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TCF20Q9UGU0 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TCF20Q9UGU0 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TCF20Q9UGU0 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TCF20Q9UGU0 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TCF20Q9UGU0 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TCF20Q9UGU0 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TCF20Q9UGU0 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TCF20Q9UGU0 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TCF20Q9UGU0 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TCF20Q9UGU0 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TCF20Q9UGU0 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TCF20Q9UGU0 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TCF20Q9UGU0 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TCF20Q9UGU0 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TCF20Q9UGU0 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
TCF20Q9UGU0 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
TCF20Q9UGU0 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TCF20Q9UGU0 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TCF20Q9UGU0 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TCF20Q9UGU0 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TCF20Q9UGU0 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TCF20Q9UGU0 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TCF20Q9UGU0 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TCF20Q9UGU0 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TCF20Q9UGU0 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TCF20Q9UGU0 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TCF20Q9UGU0 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TCF20Q9UGU0 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TCF20Q9UGU0 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TCF20Q9UGU0 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TCF20Q9UGU0 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TCF20Q9UGU0 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TCF20Q9UGU0 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TCF20Q9UGU0 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TCF20Q9UGU0 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TCF20Q9UGU0 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
TCF20Q9UGU0 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TCF20Q9UGU0 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TCF20Q9UGU0 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TCF20Q9UGU0 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TCF20Q9UGU0 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TCF20Q9UGU0 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
TCF20Q9UGU0 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
TCF20Q9UGU0 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TCF20Q9UGU0 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TCF20Q9UGU0 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TCF20Q9UGU0 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TCF20Q9UGU0 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TCF20Q9UGU0 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TCF20Q9UGU0 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TCF20Q9UGU0 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TCF20Q9UGU0 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TCF20Q9UGU0 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TCF20Q9UGU0 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TCF20Q9UGU0 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TCF20Q9UGU0 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TCF20Q9UGU0 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TCF20Q9UGU0 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TCF20Q9UGU0 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TCF20Q9UGU0 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
TCF20Q9UGU0 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TCF20Q9UGU0 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TCF20Q9UGU0 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TCF20Q9UGU0 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TCF20Q9UGU0 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TCF20Q9UGU0 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TCF20Q9UGU0 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TCF20Q9UGU0 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TCF20Q9UGU0 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TCF20Q9UGU0 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TCF20Q9UGU0 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TCF20Q9UGU0 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TCF20Q9UGU0 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TCF20Q9UGU0 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TCF20Q9UGU0 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TCF20Q9UGU0 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TCF20Q9UGU0 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TCF20Q9UGU0 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TCF20Q9UGU0 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
TCF20Q9UGU0 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TCF20Q9UGU0 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TCF20Q9UGU0 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
TCF20Q9UGU0 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
TCF20Q9UGU0 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TCF20Q9UGU0 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TCF20Q9UGU0 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
TCF20Q9UGU0 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
TCF20Q9UGU0 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms