Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFF9

CNOT8, CCR4-NOT transcription complex subunit 8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT8Q9UFF9 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CNOT8Q9UFF9 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CNOT8Q9UFF9 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CNOT8Q9UFF9 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CNOT8Q9UFF9 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CNOT8Q9UFF9 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CNOT8Q9UFF9 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CNOT8Q9UFF9 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CNOT8Q9UFF9 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CNOT8Q9UFF9 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CNOT8Q9UFF9 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CNOT8Q9UFF9 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CNOT8Q9UFF9 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CNOT8Q9UFF9 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CNOT8Q9UFF9 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CNOT8Q9UFF9 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CNOT8Q9UFF9 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CNOT8Q9UFF9 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CNOT8Q9UFF9 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CNOT8Q9UFF9 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CNOT8Q9UFF9 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CNOT8Q9UFF9 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CNOT8Q9UFF9 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CNOT8Q9UFF9 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CNOT8Q9UFF9 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CNOT8Q9UFF9 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CNOT8Q9UFF9 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CNOT8Q9UFF9 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CNOT8Q9UFF9 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CNOT8Q9UFF9 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CNOT8Q9UFF9 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CNOT8Q9UFF9 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CNOT8Q9UFF9 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CNOT8Q9UFF9 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CNOT8Q9UFF9 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CNOT8Q9UFF9 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CNOT8Q9UFF9 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CNOT8Q9UFF9 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CNOT8Q9UFF9 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CNOT8Q9UFF9 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CNOT8Q9UFF9 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CNOT8Q9UFF9 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CNOT8Q9UFF9 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CNOT8Q9UFF9 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CNOT8Q9UFF9 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CNOT8Q9UFF9 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CNOT8Q9UFF9 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CNOT8Q9UFF9 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CNOT8Q9UFF9 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CNOT8Q9UFF9 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CNOT8Q9UFF9 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CNOT8Q9UFF9 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CNOT8Q9UFF9 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CNOT8Q9UFF9 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CNOT8Q9UFF9 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CNOT8Q9UFF9 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CNOT8Q9UFF9 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CNOT8Q9UFF9 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CNOT8Q9UFF9 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CNOT8Q9UFF9 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CNOT8Q9UFF9 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CNOT8Q9UFF9 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CNOT8Q9UFF9 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CNOT8Q9UFF9 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CNOT8Q9UFF9 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CNOT8Q9UFF9 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CNOT8Q9UFF9 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CNOT8Q9UFF9 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CNOT8Q9UFF9 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CNOT8Q9UFF9 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CNOT8Q9UFF9 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CNOT8Q9UFF9 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CNOT8Q9UFF9 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CNOT8Q9UFF9 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CNOT8Q9UFF9 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CNOT8Q9UFF9 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CNOT8Q9UFF9 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CNOT8Q9UFF9 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CNOT8Q9UFF9 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CNOT8Q9UFF9 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CNOT8Q9UFF9 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CNOT8Q9UFF9 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CNOT8Q9UFF9 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CNOT8Q9UFF9 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CNOT8Q9UFF9 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CNOT8Q9UFF9 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CNOT8Q9UFF9 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CNOT8Q9UFF9 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CNOT8Q9UFF9 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CNOT8Q9UFF9 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CNOT8Q9UFF9 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CNOT8Q9UFF9 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CNOT8Q9UFF9 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CNOT8Q9UFF9 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CNOT8Q9UFF9 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CNOT8Q9UFF9 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CNOT8Q9UFF9 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CNOT8Q9UFF9 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CNOT8Q9UFF9 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CNOT8Q9UFF9 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.9 ms