Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

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Length 275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
COPS7AQ9UBW8 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
COPS7AQ9UBW8 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
COPS7AQ9UBW8 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
COPS7AQ9UBW8 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
COPS7AQ9UBW8 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
COPS7AQ9UBW8 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
COPS7AQ9UBW8 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
COPS7AQ9UBW8 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
COPS7AQ9UBW8 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
COPS7AQ9UBW8 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
COPS7AQ9UBW8 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
COPS7AQ9UBW8 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
COPS7AQ9UBW8 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
COPS7AQ9UBW8 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
COPS7AQ9UBW8 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
COPS7AQ9UBW8 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
COPS7AQ9UBW8 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
COPS7AQ9UBW8 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
COPS7AQ9UBW8 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
COPS7AQ9UBW8 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
COPS7AQ9UBW8 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
COPS7AQ9UBW8 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
COPS7AQ9UBW8 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
COPS7AQ9UBW8 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
COPS7AQ9UBW8 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
COPS7AQ9UBW8 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
COPS7AQ9UBW8 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
COPS7AQ9UBW8 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
COPS7AQ9UBW8 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
COPS7AQ9UBW8 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
COPS7AQ9UBW8 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
COPS7AQ9UBW8 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
COPS7AQ9UBW8 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
COPS7AQ9UBW8 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
COPS7AQ9UBW8 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
COPS7AQ9UBW8 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
COPS7AQ9UBW8 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
COPS7AQ9UBW8 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
COPS7AQ9UBW8 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
COPS7AQ9UBW8 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
COPS7AQ9UBW8 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
COPS7AQ9UBW8 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
COPS7AQ9UBW8 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
COPS7AQ9UBW8 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
COPS7AQ9UBW8 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
COPS7AQ9UBW8 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
COPS7AQ9UBW8 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
COPS7AQ9UBW8 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
COPS7AQ9UBW8 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
COPS7AQ9UBW8 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
COPS7AQ9UBW8 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
COPS7AQ9UBW8 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
COPS7AQ9UBW8 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
COPS7AQ9UBW8 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
COPS7AQ9UBW8 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
COPS7AQ9UBW8 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
COPS7AQ9UBW8 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
COPS7AQ9UBW8 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
COPS7AQ9UBW8 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
COPS7AQ9UBW8 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
COPS7AQ9UBW8 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
COPS7AQ9UBW8 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
COPS7AQ9UBW8 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
COPS7AQ9UBW8 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
COPS7AQ9UBW8 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
COPS7AQ9UBW8 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
COPS7AQ9UBW8 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
COPS7AQ9UBW8 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
COPS7AQ9UBW8 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
COPS7AQ9UBW8 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
COPS7AQ9UBW8 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
COPS7AQ9UBW8 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
COPS7AQ9UBW8 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
COPS7AQ9UBW8 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
COPS7AQ9UBW8 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
COPS7AQ9UBW8 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
COPS7AQ9UBW8 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
COPS7AQ9UBW8 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
COPS7AQ9UBW8 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
COPS7AQ9UBW8 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
COPS7AQ9UBW8 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
COPS7AQ9UBW8 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
COPS7AQ9UBW8 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
COPS7AQ9UBW8 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
COPS7AQ9UBW8 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
COPS7AQ9UBW8 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
COPS7AQ9UBW8 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
COPS7AQ9UBW8 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
COPS7AQ9UBW8 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
COPS7AQ9UBW8 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
COPS7AQ9UBW8 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
COPS7AQ9UBW8 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
COPS7AQ9UBW8 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
COPS7AQ9UBW8 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
COPS7AQ9UBW8 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
COPS7AQ9UBW8 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
COPS7AQ9UBW8 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
COPS7AQ9UBW8 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
COPS7AQ9UBW8 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
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