Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT6

POLK, DNA polymerase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLKQ9UBT6 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
POLKQ9UBT6 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
POLKQ9UBT6 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
POLKQ9UBT6 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
POLKQ9UBT6 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC31■■■□□ 2.55
POLKQ9UBT6 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC31■■■□□ 2.55
POLKQ9UBT6 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
POLKQ9UBT6 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
POLKQ9UBT6 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
POLKQ9UBT6 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
POLKQ9UBT6 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
POLKQ9UBT6 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
POLKQ9UBT6 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
POLKQ9UBT6 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
POLKQ9UBT6 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
POLKQ9UBT6 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
POLKQ9UBT6 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
POLKQ9UBT6 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
POLKQ9UBT6 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
POLKQ9UBT6 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
POLKQ9UBT6 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
POLKQ9UBT6 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
POLKQ9UBT6 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC30.98■■■□□ 2.55
POLKQ9UBT6 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
POLKQ9UBT6 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
POLKQ9UBT6 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
POLKQ9UBT6 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
POLKQ9UBT6 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
POLKQ9UBT6 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC30.97■■■□□ 2.55
POLKQ9UBT6 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
POLKQ9UBT6 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
POLKQ9UBT6 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
POLKQ9UBT6 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
POLKQ9UBT6 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
POLKQ9UBT6 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
POLKQ9UBT6 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
POLKQ9UBT6 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
POLKQ9UBT6 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
POLKQ9UBT6 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
POLKQ9UBT6 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
POLKQ9UBT6 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
POLKQ9UBT6 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.55
POLKQ9UBT6 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.54
POLKQ9UBT6 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
POLKQ9UBT6 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
POLKQ9UBT6 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
POLKQ9UBT6 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
POLKQ9UBT6 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
POLKQ9UBT6 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
POLKQ9UBT6 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
POLKQ9UBT6 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
POLKQ9UBT6 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
POLKQ9UBT6 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
POLKQ9UBT6 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
POLKQ9UBT6 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
POLKQ9UBT6 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
POLKQ9UBT6 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
POLKQ9UBT6 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
POLKQ9UBT6 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
POLKQ9UBT6 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
POLKQ9UBT6 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
POLKQ9UBT6 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
POLKQ9UBT6 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
POLKQ9UBT6 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
POLKQ9UBT6 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
POLKQ9UBT6 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
POLKQ9UBT6 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
POLKQ9UBT6 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
POLKQ9UBT6 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
POLKQ9UBT6 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
POLKQ9UBT6 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
POLKQ9UBT6 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
POLKQ9UBT6 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
POLKQ9UBT6 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
POLKQ9UBT6 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
POLKQ9UBT6 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.53
POLKQ9UBT6 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
POLKQ9UBT6 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
POLKQ9UBT6 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
POLKQ9UBT6 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
POLKQ9UBT6 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
POLKQ9UBT6 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
POLKQ9UBT6 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
POLKQ9UBT6 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
POLKQ9UBT6 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
POLKQ9UBT6 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
POLKQ9UBT6 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
POLKQ9UBT6 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
POLKQ9UBT6 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
POLKQ9UBT6 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
POLKQ9UBT6 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
POLKQ9UBT6 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
POLKQ9UBT6 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
POLKQ9UBT6 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
POLKQ9UBT6 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.85■■■□□ 2.53
POLKQ9UBT6 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
POLKQ9UBT6 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
POLKQ9UBT6 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
POLKQ9UBT6 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
POLKQ9UBT6 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC30.85■■■□□ 2.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms