Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBS5

GABBR1, Gamma-aminobutyric acid type B receptor subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABBR1Q9UBS5 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GABBR1Q9UBS5 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GABBR1Q9UBS5 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GABBR1Q9UBS5 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GABBR1Q9UBS5 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GABBR1Q9UBS5 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GABBR1Q9UBS5 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
GABBR1Q9UBS5 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
GABBR1Q9UBS5 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GABBR1Q9UBS5 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GABBR1Q9UBS5 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GABBR1Q9UBS5 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GABBR1Q9UBS5 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GABBR1Q9UBS5 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GABBR1Q9UBS5 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GABBR1Q9UBS5 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GABBR1Q9UBS5 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GABBR1Q9UBS5 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GABBR1Q9UBS5 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GABBR1Q9UBS5 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GABBR1Q9UBS5 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GABBR1Q9UBS5 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GABBR1Q9UBS5 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GABBR1Q9UBS5 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GABBR1Q9UBS5 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GABBR1Q9UBS5 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GABBR1Q9UBS5 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GABBR1Q9UBS5 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GABBR1Q9UBS5 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GABBR1Q9UBS5 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GABBR1Q9UBS5 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GABBR1Q9UBS5 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GABBR1Q9UBS5 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GABBR1Q9UBS5 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GABBR1Q9UBS5 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GABBR1Q9UBS5 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GABBR1Q9UBS5 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
GABBR1Q9UBS5 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GABBR1Q9UBS5 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GABBR1Q9UBS5 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GABBR1Q9UBS5 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GABBR1Q9UBS5 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GABBR1Q9UBS5 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GABBR1Q9UBS5 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GABBR1Q9UBS5 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GABBR1Q9UBS5 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GABBR1Q9UBS5 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GABBR1Q9UBS5 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GABBR1Q9UBS5 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GABBR1Q9UBS5 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
GABBR1Q9UBS5 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
GABBR1Q9UBS5 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GABBR1Q9UBS5 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GABBR1Q9UBS5 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
GABBR1Q9UBS5 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GABBR1Q9UBS5 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
GABBR1Q9UBS5 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
GABBR1Q9UBS5 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
GABBR1Q9UBS5 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GABBR1Q9UBS5 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GABBR1Q9UBS5 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GABBR1Q9UBS5 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GABBR1Q9UBS5 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GABBR1Q9UBS5 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GABBR1Q9UBS5 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GABBR1Q9UBS5 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GABBR1Q9UBS5 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GABBR1Q9UBS5 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
GABBR1Q9UBS5 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GABBR1Q9UBS5 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GABBR1Q9UBS5 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GABBR1Q9UBS5 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GABBR1Q9UBS5 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GABBR1Q9UBS5 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GABBR1Q9UBS5 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GABBR1Q9UBS5 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GABBR1Q9UBS5 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GABBR1Q9UBS5 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
GABBR1Q9UBS5 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GABBR1Q9UBS5 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GABBR1Q9UBS5 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GABBR1Q9UBS5 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GABBR1Q9UBS5 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GABBR1Q9UBS5 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
GABBR1Q9UBS5 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
GABBR1Q9UBS5 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GABBR1Q9UBS5 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GABBR1Q9UBS5 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
GABBR1Q9UBS5 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GABBR1Q9UBS5 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GABBR1Q9UBS5 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GABBR1Q9UBS5 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GABBR1Q9UBS5 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GABBR1Q9UBS5 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GABBR1Q9UBS5 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GABBR1Q9UBS5 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GABBR1Q9UBS5 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
GABBR1Q9UBS5 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GABBR1Q9UBS5 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GABBR1Q9UBS5 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms