Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2I0

CPSF2, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPSF2Q9P2I0 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CPSF2Q9P2I0 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CPSF2Q9P2I0 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CPSF2Q9P2I0 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CPSF2Q9P2I0 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CPSF2Q9P2I0 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CPSF2Q9P2I0 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CPSF2Q9P2I0 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CPSF2Q9P2I0 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CPSF2Q9P2I0 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CPSF2Q9P2I0 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CPSF2Q9P2I0 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CPSF2Q9P2I0 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CPSF2Q9P2I0 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CPSF2Q9P2I0 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CPSF2Q9P2I0 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CPSF2Q9P2I0 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CPSF2Q9P2I0 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CPSF2Q9P2I0 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CPSF2Q9P2I0 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CPSF2Q9P2I0 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CPSF2Q9P2I0 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CPSF2Q9P2I0 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CPSF2Q9P2I0 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CPSF2Q9P2I0 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CPSF2Q9P2I0 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CPSF2Q9P2I0 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CPSF2Q9P2I0 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CPSF2Q9P2I0 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CPSF2Q9P2I0 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CPSF2Q9P2I0 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CPSF2Q9P2I0 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CPSF2Q9P2I0 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CPSF2Q9P2I0 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CPSF2Q9P2I0 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CPSF2Q9P2I0 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CPSF2Q9P2I0 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CPSF2Q9P2I0 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CPSF2Q9P2I0 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CPSF2Q9P2I0 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CPSF2Q9P2I0 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CPSF2Q9P2I0 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CPSF2Q9P2I0 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CPSF2Q9P2I0 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CPSF2Q9P2I0 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CPSF2Q9P2I0 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CPSF2Q9P2I0 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CPSF2Q9P2I0 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CPSF2Q9P2I0 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CPSF2Q9P2I0 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CPSF2Q9P2I0 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CPSF2Q9P2I0 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CPSF2Q9P2I0 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CPSF2Q9P2I0 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CPSF2Q9P2I0 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CPSF2Q9P2I0 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CPSF2Q9P2I0 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CPSF2Q9P2I0 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CPSF2Q9P2I0 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CPSF2Q9P2I0 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CPSF2Q9P2I0 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CPSF2Q9P2I0 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CPSF2Q9P2I0 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CPSF2Q9P2I0 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CPSF2Q9P2I0 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CPSF2Q9P2I0 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CPSF2Q9P2I0 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CPSF2Q9P2I0 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CPSF2Q9P2I0 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CPSF2Q9P2I0 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CPSF2Q9P2I0 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CPSF2Q9P2I0 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CPSF2Q9P2I0 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CPSF2Q9P2I0 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CPSF2Q9P2I0 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CPSF2Q9P2I0 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CPSF2Q9P2I0 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CPSF2Q9P2I0 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CPSF2Q9P2I0 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CPSF2Q9P2I0 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CPSF2Q9P2I0 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CPSF2Q9P2I0 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CPSF2Q9P2I0 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CPSF2Q9P2I0 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CPSF2Q9P2I0 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CPSF2Q9P2I0 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CPSF2Q9P2I0 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CPSF2Q9P2I0 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CPSF2Q9P2I0 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CPSF2Q9P2I0 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CPSF2Q9P2I0 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CPSF2Q9P2I0 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CPSF2Q9P2I0 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CPSF2Q9P2I0 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CPSF2Q9P2I0 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CPSF2Q9P2I0 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CPSF2Q9P2I0 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CPSF2Q9P2I0 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CPSF2Q9P2I0 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CPSF2Q9P2I0 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms