Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2D1

CHD7, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 2,997 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD7Q9P2D1 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CHD7Q9P2D1 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHD7Q9P2D1 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHD7Q9P2D1 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHD7Q9P2D1 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHD7Q9P2D1 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHD7Q9P2D1 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHD7Q9P2D1 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHD7Q9P2D1 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHD7Q9P2D1 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHD7Q9P2D1 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHD7Q9P2D1 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHD7Q9P2D1 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHD7Q9P2D1 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHD7Q9P2D1 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CHD7Q9P2D1 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHD7Q9P2D1 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHD7Q9P2D1 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHD7Q9P2D1 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHD7Q9P2D1 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHD7Q9P2D1 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHD7Q9P2D1 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHD7Q9P2D1 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHD7Q9P2D1 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHD7Q9P2D1 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHD7Q9P2D1 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHD7Q9P2D1 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHD7Q9P2D1 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHD7Q9P2D1 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CHD7Q9P2D1 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CHD7Q9P2D1 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHD7Q9P2D1 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHD7Q9P2D1 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHD7Q9P2D1 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHD7Q9P2D1 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHD7Q9P2D1 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHD7Q9P2D1 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CHD7Q9P2D1 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHD7Q9P2D1 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHD7Q9P2D1 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHD7Q9P2D1 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHD7Q9P2D1 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHD7Q9P2D1 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHD7Q9P2D1 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHD7Q9P2D1 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHD7Q9P2D1 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHD7Q9P2D1 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHD7Q9P2D1 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHD7Q9P2D1 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHD7Q9P2D1 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHD7Q9P2D1 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CHD7Q9P2D1 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHD7Q9P2D1 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CHD7Q9P2D1 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHD7Q9P2D1 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHD7Q9P2D1 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHD7Q9P2D1 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CHD7Q9P2D1 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHD7Q9P2D1 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHD7Q9P2D1 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHD7Q9P2D1 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHD7Q9P2D1 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CHD7Q9P2D1 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHD7Q9P2D1 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHD7Q9P2D1 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHD7Q9P2D1 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHD7Q9P2D1 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CHD7Q9P2D1 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CHD7Q9P2D1 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CHD7Q9P2D1 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CHD7Q9P2D1 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CHD7Q9P2D1 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CHD7Q9P2D1 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CHD7Q9P2D1 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
CHD7Q9P2D1 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CHD7Q9P2D1 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CHD7Q9P2D1 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CHD7Q9P2D1 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHD7Q9P2D1 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHD7Q9P2D1 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHD7Q9P2D1 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHD7Q9P2D1 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHD7Q9P2D1 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHD7Q9P2D1 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHD7Q9P2D1 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHD7Q9P2D1 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHD7Q9P2D1 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHD7Q9P2D1 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHD7Q9P2D1 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHD7Q9P2D1 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHD7Q9P2D1 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHD7Q9P2D1 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHD7Q9P2D1 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHD7Q9P2D1 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHD7Q9P2D1 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHD7Q9P2D1 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHD7Q9P2D1 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHD7Q9P2D1 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHD7Q9P2D1 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHD7Q9P2D1 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms